265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2248 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  100 
 
 
236 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.24176e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  42.65 
 
 
216 aa  162  4e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  42.65 
 
 
216 aa  162  4e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  42.72 
 
 
216 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  6.07321e-13 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  36.07 
 
 
216 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  34.25 
 
 
221 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
204 aa  119  5e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  31.19 
 
 
218 aa  113  2e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  32.17 
 
 
243 aa  110  2e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  33.33 
 
 
216 aa  108  8e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 
221 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  35.61 
 
 
217 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  31.72 
 
 
240 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  31.72 
 
 
240 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  31.72 
 
 
240 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  32.58 
 
 
221 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  36.67 
 
 
218 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  30.14 
 
 
235 aa  102  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  4.97465e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  34.88 
 
 
230 aa  99  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 
228 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  29.05 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  33.48 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  35.53 
 
 
219 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  30.77 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  29.87 
 
 
231 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  32.63 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  40.69 
 
 
222 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.86349e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  33.68 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  33.68 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  9.53974e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  32.31 
 
 
215 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  1.54774e-08 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  33.16 
 
 
233 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  33.7 
 
 
229 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.8003e-08  unclonable  8.89639e-06 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  33.79 
 
 
207 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  33.01 
 
 
215 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 
229 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  29.28 
 
 
237 aa  89  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  32.54 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  33.15 
 
 
229 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.19805e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  34.43 
 
 
221 aa  82.4  5e-15  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  30.52 
 
 
234 aa  81.6  1e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.38 
 
 
220 aa  80.1  3e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  4.3506e-09  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  33 
 
 
263 aa  76.6  3e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  30.46 
 
 
213 aa  77  3e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  37.8 
 
 
133 aa  75.5  7e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  50.79 
 
 
135 aa  72.4  5e-12  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  50.79 
 
 
135 aa  72.4  5e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  32.18 
 
 
240 aa  72.8  5e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  32.16 
 
 
240 aa  72.4  6e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  29.52 
 
 
222 aa  72  7e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  52.31 
 
 
131 aa  71.6  1e-11  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.18001e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  32.82 
 
 
243 aa  71.6  1e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46435e-05 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  27.14 
 
 
209 aa  68.6  8e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  27.19 
 
 
232 aa  66.6  3e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  1.08036e-07  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  26.5 
 
 
209 aa  67  3e-10  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  30.48 
 
 
227 aa  65.9  5e-10  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  30.11 
 
 
215 aa  64.7  1e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  35.11 
 
 
225 aa  64.3  2e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  32.58 
 
 
224 aa  62.4  5e-09  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  28.63 
 
 
225 aa  62.4  6e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  30.17 
 
 
238 aa  61.2  1e-08  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  30.17 
 
 
216 aa  61.2  1e-08  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  5.55461e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  38.46 
 
 
135 aa  60.1  3e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  38.46 
 
 
135 aa  60.1  3e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12390  4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erythritol synthase  44.83 
 
 
321 aa  59.7  4e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  23.87 
 
 
216 aa  59.7  4e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  26.82 
 
 
234 aa  59.3  5e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  6.5299e-07 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  27.6 
 
 
227 aa  58.9  6e-08  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  43.75 
 
 
235 aa  58.9  7e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  27.19 
 
 
219 aa  57.8  2e-07  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  26.75 
 
 
234 aa  57.4  2e-07  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  25.23 
 
 
224 aa  56.6  3e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  4.95428e-05  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1481  peptidase S24, LexA repressor  31.41 
 
 
207 aa  55.5  7e-07  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.939319  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  32.74 
 
 
239 aa  55.1  9e-07  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  1.25637e-06 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1163  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 
129 aa  55.1  1e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  27.63 
 
 
214 aa  54.7  1e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  40 
 
 
273 aa  54.3  1e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  24.19 
 
 
209 aa  54.3  2e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90673e-25 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
152 aa  53.5  3e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0987  XRE family transcriptional regulator  24.19 
 
 
261 aa  52.8  5e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  1.24238e-07  decreased coverage  8.98334e-18 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14611  SOS function regulatory protein, LexA repressor  34.07 
 
 
205 aa  52.8  5e-06  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1531  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 
189 aa  52.4  7e-06  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  2.56618e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  27.27 
 
 
241 aa  52.4  7e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 
206 aa  52  8e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 
152 aa  52  9e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  23.72 
 
 
209 aa  52  9e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0552  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 
71 aa  51.2  1e-05  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.162215  hitchhiker  8.52105e-05 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.38 
 
 
207 aa  51.2  1e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  25.11 
 
 
222 aa  50.4  2e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  7.99679e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 
380 aa  51.2  2e-05  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  31.91 
 
 
201 aa  50.8  2e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.13097e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  23.47 
 
 
235 aa  50.8  2e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  50 
 
 
401 aa  50.4  2e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  1.96734e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13051  SOS function regulatory protein, LexA repressor  31.82 
 
 
202 aa  50.1  3e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  29.11 
 
 
223 aa  50.1  3e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  4.01895e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  29.1 
 
 
210 aa  50.1  3e-05  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.25213e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1781  putative prophage repressor  32.93 
 
 
194 aa  50.1  3e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  5.1926e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  31.21 
 
 
210 aa  50.1  3e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0191  hypothetical protein  24.76 
 
 
215 aa  49.7  4e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  35.53 
 
 
338 aa  49.3  5e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>