121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0890 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  100 
 
 		 763 aa  1582    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  99.34 
 
 		 763 aa  1571    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  41.67 
 
 		 775 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  41.51 
 
 		 775 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  100 
 
 		 273 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  41.19 
 
 		 777 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  41 
 
 		 777 aa  551  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  39.75 
 
 		 776 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  40.56 
 
 		 777 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  40.56 
 
 		 777 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  39.74 
 
 		 777 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  40.43 
 
 		 777 aa  538  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  51.47 
 
 		 605 aa  474  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  49.44 
 
 		 477 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  49.69 
 
 		 899 aa  297  5e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  49.09 
 
 		 878 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  43.96 
 
 		 681 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  43.65 
 
 		 681 aa  254  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  42.43 
 
 		 678 aa  253  7e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  44.44 
 
 		 895 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  46.08 
 
 		 890 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  45.45 
 
 		 890 aa  241  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  40.18 
 
 		 929 aa  209  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  30.18 
 
 		 636 aa  198  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  33.22 
 
 		 368 aa  124  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  28.62 
 
 		 338 aa  106  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  40.94 
 
 		 277 aa  92.8  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  37.95 
 
 		 782 aa  90.9  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  24.94 
 
 		 1000 aa  90.9  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  25.06 
 
 		 1172 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  27.27 
 
 		 1172 aa  88.2  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  29.02 
 
 		 1145 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  34.62 
 
 		 744 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  38.82 
 
 		 813 aa  79  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  28.66 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  33.96 
 
 		 848 aa  77.8  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  37.19 
 
 		 326 aa  76.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3668  integrase family protein  46.74 
 
 		 269 aa  76.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  33.96 
 
 		 746 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  46.07 
 
 		 866 aa  75.1  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  27.62 
 
 		 847 aa  74.7  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  33.92 
 
 		 778 aa  74.3  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  24.62 
 
 		 632 aa  72.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  32.46 
 
 		 1077 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  33.87 
 
 		 739 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  32.56 
 
 		 835 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  36.3 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  40.83 
 
 		 986 aa  68.6  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  38.46 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  31.35 
 
 		 833 aa  67.4  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  38.46 
 
 		 621 aa  67  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  24.59 
 
 		 486 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  26.74 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  36.36 
 
 		 736 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  26.99 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  39.5 
 
 		 1448 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1504  hypothetical protein  36.36 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  38.66 
 
 		 1448 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  31.45 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  32.03 
 
 		 896 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  34.59 
 
 		 1557 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  25.45 
 
 		 321 aa  63.9  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  23.2 
 
 		 542 aa  63.2  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  38.46 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  39.32 
 
 		 1495 aa  62.4  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  24.63 
 
 		 1285 aa  62  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  34.9 
 
 		 271 aa  62  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  35.24 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  37.5 
 
 		 797 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  43.82 
 
 		 1580 aa  61.6  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  31.29 
 
 		 950 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  33.55 
 
 		 1389 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  31.37 
 
 		 818 aa  60.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  31.47 
 
 		 955 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  22.13 
 
 		 738 aa  59.3  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6277  phage P4 alpha zinc-binding protein  45.1 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  31.65 
 
 		 953 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5216  P4 alpha zinc-binding domain protein  51.22 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1551  P4 alpha zinc-binding domain protein  51.22 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  32.24 
 
 		 1255 aa  57.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  32.17 
 
 		 958 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  32.17 
 
 		 958 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  27.59 
 
 		 303 aa  57.4  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  27.53 
 
 		 463 aa  56.2  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  30.38 
 
 		 953 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  20.5 
 
 		 900 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5218  Phage P4 alpha, zinc-binding  36.56 
 
 		 355 aa  55.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  29.71 
 
 		 297 aa  54.7  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  23.58 
 
 		 531 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  24.47 
 
 		 717 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  24.58 
 
 		 695 aa  53.5  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  25.08 
 
 		 334 aa  53.5  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40670  DnaG-like primase protein  32.48 
 
 		 128 aa  53.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0564  ATPase-like  22.49 
 
 		 902 aa  52.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0661178  normal  0.572377 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  24.47 
 
 		 717 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  36.17 
 
 		 371 aa  52  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  22.25 
 
 		 828 aa  51.6  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  25.51 
 
 		 524 aa  51.2  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  36.54 
 
 		 361 aa  50.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>