168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0429 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  96.17 
 
 		 339 aa  673    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  97.05 
 
 		 339 aa  679    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  93.81 
 
 		 339 aa  653    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  98.53 
 
 		 339 aa  689    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  100 
 
 		 339 aa  698    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  97.35 
 
 		 339 aa  682    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  93.51 
 
 		 339 aa  650    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  89.68 
 
 		 339 aa  634    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  89.09 
 
 		 339 aa  620  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  54.36 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  54.36 
 
 		 344 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  57.14 
 
 		 182 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  38.84 
 
 		 349 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  39.75 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2649  phage integrase family protein  51.61 
 
 		 160 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01846  hypothetical protein  67.01 
 
 		 153 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  35.44 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  33.59 
 
 		 329 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  30.72 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  33.5 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  30.95 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  30.53 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  27.45 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  29.32 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  27.87 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  28.04 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  29.54 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  29.11 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  28.77 
 
 		 368 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  31.94 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  26.89 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  26.96 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  28.88 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  29.48 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  27.47 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  25.84 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  32.48 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.63 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  23.11 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  28.22 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  25.18 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  27.02 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  26.81 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  25.24 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  33.1 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  26.27 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1203  hypothetical protein  27.35 
 
 		 360 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000176468  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  28.64 
 
 		 270 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  30.77 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  26.29 
 
 		 456 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  28.18 
 
 		 270 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  28.18 
 
 		 270 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  26.29 
 
 		 451 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  26.75 
 
 		 451 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  30.77 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  25.62 
 
 		 342 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  30.77 
 
 		 359 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.34 
 
 		 311 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0057  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.01 
 
 		 369 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  27.23 
 
 		 360 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  28.89 
 
 		 368 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  30.77 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  25.54 
 
 		 451 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  28.18 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  26.73 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  28.18 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  25.2 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.68 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.73 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  25.2 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.73 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.73 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  30.81 
 
 		 359 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  25.82 
 
 		 297 aa  49.7  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3697  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.05 
 
 		 328 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3973  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.56 
 
 		 311 aa  49.3  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.556004  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  24.89 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  28.77 
 
 		 413 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.77 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  29.34 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  29.34 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1455  integrase family protein  23.83 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  28.77 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  30.61 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  22.63 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  28.77 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3835  tyrosine recombinase XerC  24.02 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.955587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  26.34 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.51 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  24.55 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  25.79 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6332  integrase family protein  25.08 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>