More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2180 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 101 aa  201  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  65.62 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  66.22 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5209  transcriptional regulator, XRE family  59.3 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1480  transcriptional regulator, XRE family  74.58 
 
 		 116 aa  87.8  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  61.33 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0211  transcriptional regulator, XRE family  51.81 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  50 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  60.94 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  45.56 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  59.72 
 
 		 191 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  59.72 
 
 		 228 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1777  helix-turn-helix domain protein  54.55 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  59.38 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  51.43 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0221  transcriptional regulator, XRE family  43.27 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1098  XRE family transcriptional regulator  62.3 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380138  normal  0.0621931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  54.69 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  46.15 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  48.86 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3701  transcriptional regulator, XRE family  66.67 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.831068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 250 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2176  putative transcriptional regulator, XRE family  60.66 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  49.28 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  42.53 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  51.39 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3937  helix-turn-helix domain protein  55.26 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  48.89 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1647  helix-turn-helix domain protein  51.22 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230686  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25230  Helix-turn-helix protein  58.93 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  43 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  52.24 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  52.46 
 
 		 255 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  51.56 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1037  transcriptional regulator, XRE family  43.3 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1539  transcriptional regulator, XRE family  52.46 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.11889 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1238  transcriptional regulator, XRE family  54.24 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  48.53 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23240  Helix-turn-helix protein  40.48 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0729263  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  50.91 
 
 		 255 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  46.38 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  46.48 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  51.61 
 
 		 414 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10510  Helix-turn-helix protein  39.29 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 		 256 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 190 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 325 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0654  transcriptional regulator, XRE family  62.3 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213362  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  50 
 
 		 236 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  50 
 
 		 236 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  50 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  50 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  50 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  50 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  50 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  50 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  36.84 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 189 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  48.21 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 496 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4259  helix-turn-helix domain-containing protein  51.52 
 
 		 153 aa  50.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0867385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 220 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 178 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 183 aa  50.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0379  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 184 aa  50.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.808324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 488 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 277 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 195 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0282  Xre family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00774991  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  41.82 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>