86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1087 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  100 
 
 		 590 aa  1189    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  34.78 
 
 		 756 aa  316  8e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  45.27 
 
 		 738 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  40.78 
 
 		 701 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  38.91 
 
 		 732 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  37.26 
 
 		 437 aa  163  9e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  43.43 
 
 		 815 aa  159  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  42.25 
 
 		 868 aa  159  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  42.25 
 
 		 868 aa  159  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  42.25 
 
 		 868 aa  159  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  34.95 
 
 		 407 aa  157  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  35.77 
 
 		 362 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  37.13 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  34.29 
 
 		 375 aa  148  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  42.37 
 
 		 867 aa  147  5e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  31.87 
 
 		 679 aa  140  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.21 
 
 		 681 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.21 
 
 		 681 aa  137  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  38.14 
 
 		 421 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  32.56 
 
 		 678 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  32.48 
 
 		 367 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  33.73 
 
 		 387 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  43.6 
 
 		 725 aa  120  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  43.1 
 
 		 880 aa  120  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  31.02 
 
 		 647 aa  114  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  28.35 
 
 		 382 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  32.44 
 
 		 717 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  31.93 
 
 		 358 aa  110  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  28.97 
 
 		 404 aa  104  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  32.2 
 
 		 277 aa  101  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  29.97 
 
 		 759 aa  100  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  28.53 
 
 		 569 aa  98.2  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  28.35 
 
 		 728 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  26.25 
 
 		 712 aa  93.6  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  26.45 
 
 		 712 aa  92.8  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  28.78 
 
 		 454 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  26.45 
 
 		 712 aa  92.8  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  32.51 
 
 		 370 aa  92.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  26.16 
 
 		 712 aa  92  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  25.46 
 
 		 720 aa  90.5  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  29.38 
 
 		 716 aa  84.3  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  23.94 
 
 		 682 aa  83.6  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  24.45 
 
 		 731 aa  79.7  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  28.08 
 
 		 719 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  40 
 
 		 718 aa  68.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  25.71 
 
 		 654 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1776 aa  65.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  29.38 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  29.35 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0059  DNA helicase  40.91 
 
 		 875 aa  58.9  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.186545  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  24.32 
 
 		 666 aa  58.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2245  hypothetical protein  26.8 
 
 		 631 aa  57.8  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.67793  normal  0.307121 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  25.75 
 
 		 587 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  26.4 
 
 		 741 aa  54.3  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  28.7 
 
 		 759 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4165  hypothetical protein  28.7 
 
 		 842 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  42.11 
 
 		 1955 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  30.39 
 
 		 248 aa  52  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2918  hypothetical protein  25.24 
 
 		 366 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  30.88 
 
 		 292 aa  51.2  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2962  hypothetical protein  25.24 
 
 		 366 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3071  hypothetical protein  25.24 
 
 		 366 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3494  hypothetical protein  28.14 
 
 		 404 aa  51.2  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000189556  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1854  hypothetical protein  25.68 
 
 		 515 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  hitchhiker  0.00705867 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0802  DnaB-like helicase-like  25.64 
 
 		 557 aa  50.4  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.507024  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  29.37 
 
 		 278 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  26.47 
 
 		 755 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  31.34 
 
 		 292 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  24.83 
 
 		 718 aa  48.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  31.3 
 
 		 1051 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  24.62 
 
 		 279 aa  47.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4421  conjugative transfer relaxase protein TraI  38.18 
 
 		 1986 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4429  conjugative transfer relaxase protein TraI  38.18 
 
 		 1986 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4392  conjugative transfer relaxase protein TraI  38.18 
 
 		 1986 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0060  hypothetical protein  27.18 
 
 		 368 aa  47.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4614  conjugative transfer relaxase protein TraI  38.18 
 
 		 1986 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.441431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4591  conjugative transfer relaxase protein TraI  38.18 
 
 		 1986 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.836035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  27.13 
 
 		 797 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  26.76 
 
 		 667 aa  46.6  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  26.34 
 
 		 760 aa  46.2  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2139  ATPase-like protein  25.25 
 
 		 642 aa  46.2  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.51863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3156  hypothetical protein  26.29 
 
 		 640 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4517  conjugative transfer relaxase protein TraI  36.36 
 
 		 1986 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  24.38 
 
 		 283 aa  44.3  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  23.56 
 
 		 765 aa  43.9  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2260  DNA primase-like protein  28.23 
 
 		 922 aa  43.5  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>