26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6524 on replicon NC_010507
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  915    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  60 
 
 
404 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  56.36 
 
 
728 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  54.55 
 
 
759 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  56.12 
 
 
382 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  29.09 
 
 
590 aa  99  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  27.65 
 
 
756 aa  89  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  26.9 
 
 
362 aa  87  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  31.23 
 
 
421 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  29.29 
 
 
678 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.57 
 
 
681 aa  83.6  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.62 
 
 
681 aa  80.5  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  28.97 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  27.78 
 
 
407 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  26.56 
 
 
679 aa  73.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  27.85 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  27.69 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  28.14 
 
 
717 aa  70.5  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  28.21 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  28.52 
 
 
387 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  27.64 
 
 
370 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  25.77 
 
 
569 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  29.08 
 
 
647 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  30.77 
 
 
464 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  26.87 
 
 
797 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1886  hypothetical protein  26.77 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>