48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1360 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  749    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  72.52 
 
 		 681 aa  531  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  73.68 
 
 		 681 aa  529  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  72.75 
 
 		 678 aa  525  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  56.05 
 
 		 466 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  45.01 
 
 		 367 aa  295  8e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  36.18 
 
 		 358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  35.77 
 
 		 590 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  36.73 
 
 		 421 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  37.6 
 
 		 647 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  30.03 
 
 		 407 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  32.91 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  33.75 
 
 		 717 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  34.48 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  30.99 
 
 		 679 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  30.83 
 
 		 756 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  32.24 
 
 		 464 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  27.84 
 
 		 569 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  33.01 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  28.74 
 
 		 759 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  26.45 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  28.14 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  32.95 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  28.29 
 
 		 728 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  30.26 
 
 		 587 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  30.41 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1724  putative DNA helicase  27.32 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  29.44 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  28.5 
 
 		 666 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  29.63 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  25.52 
 
 		 796 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  27.81 
 
 		 654 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  27.36 
 
 		 712 aa  50.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2522  hypothetical protein  37.18 
 
 		 487 aa  50.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694376  normal  0.231254 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  27.36 
 
 		 712 aa  50.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  27.36 
 
 		 712 aa  50.4  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1854  hypothetical protein  27 
 
 		 515 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  hitchhiker  0.00705867 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  27.36 
 
 		 712 aa  50.4  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  26.59 
 
 		 741 aa  49.7  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  27 
 
 		 279 aa  49.7  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  28.12 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  33.75 
 
 		 437 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0802  DnaB-like helicase-like  24.06 
 
 		 557 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.507024  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  44.12 
 
 		 720 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  34.58 
 
 		 716 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  40 
 
 		 248 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4702  hypothetical protein  30.21 
 
 		 891 aa  43.9  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  36.9 
 
 		 667 aa  43.1  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>