42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3980 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  100 
 
 		 728 aa  1472    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  48.73 
 
 		 759 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  63.84 
 
 		 404 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  55.9 
 
 		 454 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  54.78 
 
 		 382 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  27.37 
 
 		 756 aa  99  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  28.35 
 
 		 590 aa  94.7  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  26.89 
 
 		 466 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  24.6 
 
 		 647 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1647  hypothetical protein  32.72 
 
 		 851 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3173  hypothetical protein  38.1 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2965  hypothetical protein  35.84 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1690  hypothetical protein  31.69 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  28.1 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  28.29 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.72 
 
 		 678 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.54 
 
 		 681 aa  74.3  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.54 
 
 		 681 aa  74.3  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  24.33 
 
 		 375 aa  73.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  26.22 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  28.88 
 
 		 717 aa  70.5  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  23.6 
 
 		 679 aa  70.5  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1589  hypothetical protein  34.44 
 
 		 187 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.159507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  30.1 
 
 		 370 aa  66.6  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  27.54 
 
 		 387 aa  67  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  26.98 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  24.5 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  31.54 
 
 		 770 aa  64.7  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  26.36 
 
 		 569 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4210  hypothetical protein  32.32 
 
 		 353 aa  56.2  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2163  hypothetical protein  36.36 
 
 		 189 aa  55.1  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  29.06 
 
 		 464 aa  54.3  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  28.93 
 
 		 774 aa  50.4  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  30.81 
 
 		 857 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1886  hypothetical protein  29.07 
 
 		 396 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  27.91 
 
 		 712 aa  47.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  25.62 
 
 		 654 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  29.22 
 
 		 712 aa  46.2  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  26.13 
 
 		 712 aa  46.2  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  27.57 
 
 		 712 aa  46.2  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  28.7 
 
 		 716 aa  45.8  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  29.76 
 
 		 848 aa  44.7  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>