37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1224 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  100 
 
 		 719 aa  1447    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2712  hypothetical protein  46.12 
 
 		 419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2671  hypothetical protein  51.89 
 
 		 352 aa  322  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00889108  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0215  hypothetical protein  45 
 
 		 445 aa  296  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.203001  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  32.98 
 
 		 743 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3116  hypothetical protein  32 
 
 		 841 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4165  hypothetical protein  30.07 
 
 		 842 aa  88.6  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  28.08 
 
 		 590 aa  79.7  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  28 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  26.95 
 
 		 667 aa  68.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1984  virulence-associated E family protein  48.72 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  27.23 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6918  hypothetical protein  43.04 
 
 		 681 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  26.43 
 
 		 283 aa  60.1  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  46.43 
 
 		 970 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  46.43 
 
 		 970 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  29.71 
 
 		 815 aa  58.5  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  27.27 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  30.36 
 
 		 701 aa  56.6  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  28.29 
 
 		 292 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  21.89 
 
 		 682 aa  55.5  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  27.8 
 
 		 292 aa  54.3  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0127  ATPase-like protein  23.94 
 
 		 389 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1724  putative DNA helicase  25.43 
 
 		 294 aa  52  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  24.32 
 
 		 716 aa  51.6  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  26.72 
 
 		 299 aa  50.8  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  34.44 
 
 		 377 aa  49.7  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  25.89 
 
 		 279 aa  48.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  25.75 
 
 		 712 aa  47.8  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  31.39 
 
 		 732 aa  47.4  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  41.18 
 
 		 749 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  25.14 
 
 		 712 aa  45.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  24.67 
 
 		 712 aa  45.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  24.65 
 
 		 712 aa  44.3  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3697  TOPRIM  24.52 
 
 		 512 aa  43.9  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.779758  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  31.53 
 
 		 278 aa  44.3  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  31.82 
 
 		 277 aa  43.9  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>