30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3653 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  782    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  39.61 
 
 
375 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  37.69 
 
 
569 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  39.5 
 
 
407 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  34.12 
 
 
681 aa  143  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  34.02 
 
 
681 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  33.09 
 
 
756 aa  136  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  36.17 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  33.45 
 
 
678 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  33.73 
 
 
590 aa  126  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  32.64 
 
 
362 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  37.23 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  29.89 
 
 
367 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  30.9 
 
 
358 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  30.16 
 
 
647 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  29.17 
 
 
679 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  27.46 
 
 
717 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  30.97 
 
 
464 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  27.24 
 
 
759 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  27.08 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  27.54 
 
 
728 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  26.69 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  27.34 
 
 
454 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  31.22 
 
 
370 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  30.6 
 
 
667 aa  57  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  22.57 
 
 
587 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2139  ATPase-like protein  26.09 
 
 
642 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.51863 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  31.21 
 
 
437 aa  50.1  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2522  hypothetical protein  27.21 
 
 
487 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694376  normal  0.231254 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  26.84 
 
 
797 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>