22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3911 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1192    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  26.37 
 
 
647 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  28.33 
 
 
370 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  28.19 
 
 
464 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  25.5 
 
 
681 aa  61.2  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  25.5 
 
 
681 aa  61.2  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  28.57 
 
 
407 aa  61.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  30.26 
 
 
362 aa  61.2  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  27.6 
 
 
367 aa  59.3  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  32.39 
 
 
421 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  25.75 
 
 
590 aa  57.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  29.23 
 
 
466 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  25.27 
 
 
678 aa  56.2  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  27.89 
 
 
717 aa  54.7  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  28.41 
 
 
248 aa  50.4  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  30.39 
 
 
569 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  22.41 
 
 
387 aa  47.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1724  putative DNA helicase  26.83 
 
 
294 aa  45.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  26.22 
 
 
299 aa  45.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  23.12 
 
 
375 aa  44.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  25.79 
 
 
358 aa  44.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  26 
 
 
292 aa  44.3  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>