20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3494 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3494  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  810    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000189556  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0060  hypothetical protein  45.86 
 
 		 368 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3071  hypothetical protein  40.6 
 
 		 366 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2918  hypothetical protein  40.6 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2962  hypothetical protein  40.6 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  31.86 
 
 		 718 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0543  hypothetical protein  35.84 
 
 		 286 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0693  hypothetical protein  27.75 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000148711  normal  0.177133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  28.14 
 
 		 590 aa  51.2  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1134  putative transcriptional regulator  25.3 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000316036  hitchhiker  0.00966616 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3667  hypothetical protein  29.44 
 
 		 518 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  30.23 
 
 		 292 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  35.16 
 
 		 621 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  30.06 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4322  hypothetical protein  20.5 
 
 		 811 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  27.78 
 
 		 717 aa  45.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  25.14 
 
 		 279 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  30.62 
 
 		 404 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  26.34 
 
 		 796 aa  43.5  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  26.27 
 
 		 665 aa  43.1  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>