37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4259 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  52.81 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  48.44 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1724  putative DNA helicase  42.49 
 
 		 294 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  42.99 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  39.83 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  38.37 
 
 		 292 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  32.13 
 
 		 667 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  31.6 
 
 		 720 aa  69.3  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  30.64 
 
 		 712 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  30.64 
 
 		 712 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  30.64 
 
 		 712 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  30.64 
 
 		 712 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  29.36 
 
 		 716 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  30.77 
 
 		 743 aa  58.9  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  30.88 
 
 		 665 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2671  hypothetical protein  25.45 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00889108  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  27.27 
 
 		 719 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  25.97 
 
 		 452 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2712  hypothetical protein  27.61 
 
 		 419 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  30.39 
 
 		 590 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  28.41 
 
 		 587 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  29.9 
 
 		 682 aa  49.3  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  26.07 
 
 		 718 aa  48.9  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0215  hypothetical protein  26.55 
 
 		 445 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.203001  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  27.96 
 
 		 796 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2129  ATPase-like protein  26.39 
 
 		 465 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  29.17 
 
 		 621 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  40 
 
 		 362 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.91 
 
 		 678 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  35.71 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  25.67 
 
 		 358 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  27.89 
 
 		 741 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.92 
 
 		 681 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.92 
 
 		 681 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  29.37 
 
 		 370 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2969  hypothetical protein  30.19 
 
 		 412 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>