54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1486 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  100 
 
 		 796 aa  1624    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0127  ATPase-like protein  53.76 
 
 		 389 aa  325  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  46.61 
 
 		 665 aa  290  9e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  41.08 
 
 		 621 aa  265  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  39.13 
 
 		 679 aa  126  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  35.75 
 
 		 667 aa  99  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2129  ATPase-like protein  30.94 
 
 		 465 aa  95.5  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3116  hypothetical protein  28.88 
 
 		 841 aa  65.1  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  29.76 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  26.47 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  32.57 
 
 		 654 aa  60.8  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0355  hypothetical protein  28.66 
 
 		 255 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0426919  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  24.89 
 
 		 681 aa  55.1  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  24.89 
 
 		 681 aa  54.7  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3156  hypothetical protein  24.66 
 
 		 640 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  29.72 
 
 		 759 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  25.52 
 
 		 362 aa  53.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  27.23 
 
 		 453 aa  51.6  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  29.65 
 
 		 299 aa  50.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  24.69 
 
 		 283 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4165  hypothetical protein  25.2 
 
 		 842 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  24.89 
 
 		 460 aa  49.3  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  21.08 
 
 		 743 aa  48.9  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  25.49 
 
 		 678 aa  48.9  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2522  hypothetical protein  29.7 
 
 		 487 aa  48.5  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694376  normal  0.231254 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  25.37 
 
 		 647 aa  48.5  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  25.45 
 
 		 456 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  27.96 
 
 		 248 aa  47.8  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  25.45 
 
 		 456 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  25.45 
 
 		 456 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  28.04 
 
 		 666 aa  47.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  24.31 
 
 		 279 aa  47  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0215  hypothetical protein  24.55 
 
 		 445 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.203001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  25.76 
 
 		 448 aa  47.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  25 
 
 		 477 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  26.76 
 
 		 866 aa  47  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3996  hypothetical protein  25.5 
 
 		 396 aa  46.6  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  23.71 
 
 		 408 aa  46.2  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0023  DNA repair protein RadA  24.6 
 
 		 444 aa  47  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0179797  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0060  hypothetical protein  26.09 
 
 		 368 aa  46.6  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3697  TOPRIM  27.13 
 
 		 512 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.779758  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  22.65 
 
 		 716 aa  46.2  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  30.68 
 
 		 718 aa  45.8  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  35.71 
 
 		 712 aa  45.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  35.71 
 
 		 712 aa  45.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  35.71 
 
 		 712 aa  45.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  35.71 
 
 		 712 aa  45.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  25.34 
 
 		 370 aa  45.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  27.81 
 
 		 496 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2898  hypothetical protein  27.57 
 
 		 825 aa  44.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.523858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  24.04 
 
 		 452 aa  44.3  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3494  hypothetical protein  25.82 
 
 		 404 aa  44.3  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000189556  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2969  hypothetical protein  26.29 
 
 		 412 aa  44.3  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  32.84 
 
 		 407 aa  44.3  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>