19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2969 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2969  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  835    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4351  hypothetical protein  52.87 
 
 		 395 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215694 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1283  AAA ATPase  49.46 
 
 		 392 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261303  normal  0.841625 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  45.1 
 
 		 797 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3697  TOPRIM  38.86 
 
 		 512 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.779758  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3667  hypothetical protein  34.23 
 
 		 518 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333104  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2513  hypothetical protein  30.38 
 
 		 536 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450265 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1388  hypothetical protein  32.52 
 
 		 206 aa  58.9  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  30.71 
 
 		 621 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  29.1 
 
 		 743 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  26.29 
 
 		 796 aa  50.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  27.95 
 
 		 665 aa  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  26.13 
 
 		 495 aa  47.4  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2671  hypothetical protein  24.41 
 
 		 352 aa  46.6  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00889108  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2712  hypothetical protein  23.46 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  24.15 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  26.61 
 
 		 483 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1210  DNA repair protein RadA  23.21 
 
 		 446 aa  43.5  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.651562  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  23.85 
 
 		 457 aa  43.1  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>