28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1677 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  931    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  28.23 
 
 		 667 aa  99.4  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  29.82 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2671  hypothetical protein  26.76 
 
 		 352 aa  67  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00889108  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  25.09 
 
 		 719 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  26.51 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  26.69 
 
 		 716 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0215  hypothetical protein  28.77 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.203001  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  26.48 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  27.27 
 
 		 743 aa  60.1  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2712  hypothetical protein  24.79 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1724  putative DNA helicase  23.55 
 
 		 294 aa  56.6  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  25 
 
 		 712 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  25 
 
 		 712 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  25 
 
 		 712 aa  55.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  25 
 
 		 712 aa  55.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  26.09 
 
 		 248 aa  55.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  26.26 
 
 		 283 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  25.28 
 
 		 279 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4165  hypothetical protein  25.97 
 
 		 842 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3116  hypothetical protein  27.81 
 
 		 841 aa  48.5  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3697  TOPRIM  26.29 
 
 		 512 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.779758  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2129  ATPase-like protein  37.18 
 
 		 465 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0543  hypothetical protein  24.37 
 
 		 286 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  24.04 
 
 		 796 aa  44.3  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  22.11 
 
 		 741 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  23.65 
 
 		 720 aa  43.5  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0060  hypothetical protein  25.71 
 
 		 368 aa  43.9  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>