21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0060 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0060  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  744    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3494  hypothetical protein  46.35 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000189556  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3071  hypothetical protein  41.31 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2918  hypothetical protein  41.31 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2962  hypothetical protein  41.31 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  33.55 
 
 		 718 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0543  hypothetical protein  34.05 
 
 		 286 aa  137  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  28.88 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3667  hypothetical protein  31.58 
 
 		 518 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333104  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0725  DNA repair protein RadA  25.22 
 
 		 441 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.573014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4322  hypothetical protein  20.7 
 
 		 811 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  27.18 
 
 		 590 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  26.09 
 
 		 796 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0749  DNA repair protein RadA  24.77 
 
 		 441 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.925672  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  32.67 
 
 		 665 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  25.26 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2129  ATPase-like protein  40.54 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  25.26 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  25.71 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  25.29 
 
 		 283 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  27.31 
 
 		 712 aa  43.5  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>