51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1825 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  100 
 
 		 299 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  48.24 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  44.79 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1724  putative DNA helicase  45.65 
 
 		 294 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  43.91 
 
 		 292 aa  215  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  41.79 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  42.99 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  28.68 
 
 		 667 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  30.45 
 
 		 452 aa  75.5  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  29.26 
 
 		 716 aa  72.4  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  27.21 
 
 		 712 aa  70.1  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  27.21 
 
 		 712 aa  70.1  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  27.21 
 
 		 712 aa  70.5  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  27.21 
 
 		 712 aa  70.1  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2712  hypothetical protein  29.91 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  27.66 
 
 		 720 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  29.96 
 
 		 743 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  30.05 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2671  hypothetical protein  25.45 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00889108  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  29.35 
 
 		 590 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0060  hypothetical protein  28.88 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  30.41 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  29.1 
 
 		 466 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  29.1 
 
 		 681 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  29.1 
 
 		 681 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  32.26 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0215  hypothetical protein  28.51 
 
 		 445 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.203001  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  28.43 
 
 		 666 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.19 
 
 		 678 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  24.34 
 
 		 731 aa  54.3  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  26.49 
 
 		 682 aa  53.1  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  26.72 
 
 		 719 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  29.65 
 
 		 796 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  25.42 
 
 		 621 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  28.9 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  27.42 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3116  hypothetical protein  23.74 
 
 		 841 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  41.43 
 
 		 717 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  25 
 
 		 718 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  26.22 
 
 		 587 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  26.5 
 
 		 647 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  24.9 
 
 		 665 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0802  DnaB-like helicase-like  30.86 
 
 		 557 aa  45.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.507024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  30.1 
 
 		 421 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2129  ATPase-like protein  26.92 
 
 		 465 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0023  cpp26  26.18 
 
 		 597 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.85156  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  30.11 
 
 		 679 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  32.43 
 
 		 404 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4351  hypothetical protein  25 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215694 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0957  DnaB-like helicase-like  25.2 
 
 		 469 aa  43.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  27.59 
 
 		 482 aa  43.5  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>