33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1724 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1724  putative DNA helicase  100 
 
 
294 aa  608  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  47.41 
 
 
283 aa  258  7e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  45.26 
 
 
279 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  47.13 
 
 
299 aa  223  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  42.05 
 
 
292 aa  208  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  42.96 
 
 
292 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  42.49 
 
 
248 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  28.15 
 
 
667 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  28.63 
 
 
743 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  27.32 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  23.55 
 
 
452 aa  56.6  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0215  hypothetical protein  28.19 
 
 
445 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.203001  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2671  hypothetical protein  25.1 
 
 
352 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00889108  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  24.07 
 
 
712 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  24.07 
 
 
712 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  24.07 
 
 
712 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  24.07 
 
 
712 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.7 
 
 
681 aa  53.5  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.88 
 
 
681 aa  53.1  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  27.88 
 
 
716 aa  52.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  27.62 
 
 
720 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.02 
 
 
678 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  25.43 
 
 
719 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3156  hypothetical protein  26.6 
 
 
640 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  26.27 
 
 
731 aa  47.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  25.26 
 
 
466 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  27.53 
 
 
666 aa  45.8  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  26.83 
 
 
587 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  27.03 
 
 
797 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  25.67 
 
 
367 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  26.01 
 
 
796 aa  43.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  27.65 
 
 
682 aa  42.7  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4165  hypothetical protein  25.99 
 
 
842 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>