29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3116 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3116  hypothetical protein  100 
 
 		 841 aa  1706    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4165  hypothetical protein  35.25 
 
 		 842 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2671  hypothetical protein  29.03 
 
 		 352 aa  103  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00889108  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  32 
 
 		 719 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2915  hypothetical protein  31.94 
 
 		 765 aa  96.3  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2712  hypothetical protein  30.63 
 
 		 419 aa  95.1  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  30.51 
 
 		 743 aa  94  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0215  hypothetical protein  29.26 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.203001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1346  hypothetical protein  30.88 
 
 		 793 aa  67.8  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  28.88 
 
 		 796 aa  65.1  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  24.42 
 
 		 665 aa  57.4  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  26.46 
 
 		 731 aa  54.7  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  25.68 
 
 		 682 aa  54.3  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  25.38 
 
 		 279 aa  52.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5295  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1349 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  27.01 
 
 		 667 aa  49.3  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3996  hypothetical protein  29.38 
 
 		 396 aa  48.9  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  27.81 
 
 		 452 aa  48.5  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  26.02 
 
 		 283 aa  48.1  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  26.21 
 
 		 292 aa  47.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  23.74 
 
 		 299 aa  47.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3697  TOPRIM  25.77 
 
 		 512 aa  46.2  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.779758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  24.88 
 
 		 292 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  24.49 
 
 		 716 aa  45.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  28.75 
 
 		 720 aa  44.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  28.28 
 
 		 712 aa  44.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  28.28 
 
 		 712 aa  44.3  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  28.28 
 
 		 712 aa  44.3  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  28.28 
 
 		 712 aa  44.3  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>