51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2542 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  100 
 
 		 292 aa  595  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  92.47 
 
 		 292 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  41.01 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  41.67 
 
 		 279 aa  222  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  43.91 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1724  putative DNA helicase  41.22 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  39.83 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  31.34 
 
 		 667 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  27.72 
 
 		 720 aa  68.9  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2671  hypothetical protein  26.59 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00889108  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  27.15 
 
 		 716 aa  65.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  25.17 
 
 		 712 aa  62.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  25.17 
 
 		 712 aa  62.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  25.17 
 
 		 712 aa  62.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  25.17 
 
 		 712 aa  62.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  27.56 
 
 		 682 aa  62  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  26.48 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  27.31 
 
 		 743 aa  59.7  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  27.68 
 
 		 741 aa  58.9  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  26.86 
 
 		 731 aa  58.2  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  25.55 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.44 
 
 		 681 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.44 
 
 		 681 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  27.8 
 
 		 719 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  30.47 
 
 		 367 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.61 
 
 		 678 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  29.44 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  29.19 
 
 		 370 aa  52.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2712  hypothetical protein  27.59 
 
 		 419 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  30.89 
 
 		 466 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  37.78 
 
 		 717 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  30.88 
 
 		 590 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0023  cpp26  27.5 
 
 		 597 aa  49.7  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.85156  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0215  hypothetical protein  25.89 
 
 		 445 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.203001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3667  hypothetical protein  27.43 
 
 		 518 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333104  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0802  DnaB-like helicase-like  22.14 
 
 		 557 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.507024  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3116  hypothetical protein  26.21 
 
 		 841 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0957  DnaB-like helicase-like  22.03 
 
 		 469 aa  47.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3697  TOPRIM  25.42 
 
 		 512 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.779758  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2616  AAA ATPase  28.33 
 
 		 674 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  25.51 
 
 		 797 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  28.21 
 
 		 621 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0060  hypothetical protein  25.26 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3494  hypothetical protein  30.06 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000189556  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  26 
 
 		 587 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2918  hypothetical protein  25.99 
 
 		 366 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2962  hypothetical protein  25.99 
 
 		 366 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3071  hypothetical protein  25.99 
 
 		 366 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  39.29 
 
 		 421 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4165  hypothetical protein  24.91 
 
 		 842 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1886  hypothetical protein  27.59 
 
 		 396 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>