41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004338 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  100 
 
 		 283 aa  586  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  57.09 
 
 		 279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1724  putative DNA helicase  47.41 
 
 		 294 aa  258  6e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  52.81 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  47.06 
 
 		 299 aa  238  5.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  41.88 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  41.01 
 
 		 292 aa  225  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  27.03 
 
 		 667 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  31.07 
 
 		 720 aa  76.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2712  hypothetical protein  28.33 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  28.05 
 
 		 743 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  30.86 
 
 		 716 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  28.26 
 
 		 712 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  28.26 
 
 		 712 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  28.26 
 
 		 712 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  28.26 
 
 		 712 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2671  hypothetical protein  26.97 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00889108  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0215  hypothetical protein  28.44 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.203001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  26.43 
 
 		 719 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  29 
 
 		 731 aa  54.7  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  26.26 
 
 		 452 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  26.56 
 
 		 682 aa  51.2  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  27.18 
 
 		 621 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  26.09 
 
 		 665 aa  50.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  24.69 
 
 		 796 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  28.12 
 
 		 362 aa  48.9  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0127  ATPase-like protein  26.59 
 
 		 389 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3116  hypothetical protein  26.02 
 
 		 841 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  26.74 
 
 		 358 aa  45.8  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  28.21 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  24.38 
 
 		 590 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3156  hypothetical protein  25.99 
 
 		 640 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0060  hypothetical protein  25.29 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  23.03 
 
 		 741 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2129  ATPase-like protein  22.81 
 
 		 465 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.19 
 
 		 681 aa  43.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.19 
 
 		 681 aa  43.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  37.68 
 
 		 678 aa  42.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  24.87 
 
 		 587 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  27.03 
 
 		 466 aa  42.7  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2616  AAA ATPase  28.93 
 
 		 674 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>