19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0215 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0215  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  908    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.203001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  45 
 
 		 719 aa  296  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2712  hypothetical protein  39.35 
 
 		 419 aa  239  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2671  hypothetical protein  41.55 
 
 		 352 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00889108  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  33.33 
 
 		 743 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3116  hypothetical protein  29.26 
 
 		 841 aa  80.9  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4165  hypothetical protein  27.54 
 
 		 842 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  28.44 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  29.31 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  27.03 
 
 		 667 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  28.77 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1724  putative DNA helicase  28.19 
 
 		 294 aa  55.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  28.51 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  25.47 
 
 		 665 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  25.89 
 
 		 292 aa  50.1  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  26.13 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  26.55 
 
 		 248 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  24.55 
 
 		 796 aa  47  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  24.77 
 
 		 621 aa  43.9  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>