18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4165 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4165  hypothetical protein  100 
 
 
842 aa  1713    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3116  hypothetical protein  35.25 
 
 
841 aa  209  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2671  hypothetical protein  28.97 
 
 
352 aa  100  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00889108  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  29.97 
 
 
719 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2712  hypothetical protein  28.76 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  27.64 
 
 
743 aa  78.2  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0215  hypothetical protein  27.54 
 
 
445 aa  65.1  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.203001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  25.1 
 
 
667 aa  55.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  28.75 
 
 
590 aa  53.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2072  hypothetical protein  25.83 
 
 
552 aa  51.2  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943738 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  24.23 
 
 
679 aa  50.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  25.2 
 
 
796 aa  48.9  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  25.97 
 
 
452 aa  48.9  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  24.68 
 
 
720 aa  46.2  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0127  ATPase-like protein  25 
 
 
389 aa  45.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.77 
 
 
681 aa  44.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.77 
 
 
681 aa  44.7  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  23.81 
 
 
712 aa  44.3  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0951779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>