26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0820 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  100 
 
 
743 aa  1495    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2671  hypothetical protein  33.96 
 
 
352 aa  172  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00889108  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2712  hypothetical protein  35.94 
 
 
419 aa  168  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0215  hypothetical protein  33.33 
 
 
445 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.203001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  32.98 
 
 
719 aa  144  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3116  hypothetical protein  30.51 
 
 
841 aa  93.6  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4165  hypothetical protein  27.64 
 
 
842 aa  78.2  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  28.73 
 
 
279 aa  73.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1724  putative DNA helicase  28.63 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  28.05 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  27.14 
 
 
667 aa  64.3  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  29.96 
 
 
299 aa  63.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  27.27 
 
 
452 aa  60.1  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  29.08 
 
 
292 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0127  ATPase-like protein  28.71 
 
 
389 aa  58.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  30.77 
 
 
248 aa  58.9  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  25.91 
 
 
292 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  24.76 
 
 
665 aa  53.5  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2969  hypothetical protein  28.8 
 
 
412 aa  50.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  24.12 
 
 
621 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  21.08 
 
 
796 aa  48.5  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  23.28 
 
 
679 aa  48.1  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  22.63 
 
 
682 aa  47.8  0.0008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2129  ATPase-like protein  24.84 
 
 
465 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4351  hypothetical protein  24.66 
 
 
395 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215694 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  27.43 
 
 
1061 aa  46.6  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>