42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0343 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  100 
 
 		 679 aa  1387    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  31.87 
 
 		 590 aa  140  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  29.89 
 
 		 756 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  35.47 
 
 		 466 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  39.13 
 
 		 796 aa  126  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  30.54 
 
 		 647 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.67 
 
 		 681 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  26.72 
 
 		 717 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.67 
 
 		 681 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  30.99 
 
 		 362 aa  112  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  26.29 
 
 		 407 aa  111  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  31.54 
 
 		 421 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  30.42 
 
 		 678 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  31.73 
 
 		 387 aa  97.4  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  27.02 
 
 		 358 aa  96.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  29.29 
 
 		 375 aa  94.7  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  26.69 
 
 		 367 aa  87  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  28.99 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  28.68 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  26.63 
 
 		 759 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  26.56 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  23.37 
 
 		 728 aa  64.3  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  23.71 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  27.85 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2522  hypothetical protein  25.57 
 
 		 487 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694376  normal  0.231254 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  25.99 
 
 		 741 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1134  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000316036  hitchhiker  0.00966616 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  25.89 
 
 		 667 aa  57  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  29.88 
 
 		 654 aa  54.7  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  26.73 
 
 		 569 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2139  ATPase-like protein  24.87 
 
 		 642 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.51863 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  22.4 
 
 		 666 aa  52  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2898  hypothetical protein  26.52 
 
 		 825 aa  52  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.523858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0957  DnaB-like helicase-like  25.29 
 
 		 469 aa  50.4  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4165  hypothetical protein  24.23 
 
 		 842 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3896  hypothetical protein  22.61 
 
 		 692 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425308  normal  0.91209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2457  hypothetical protein  32.5 
 
 		 820 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0802  DnaB-like helicase-like  25.27 
 
 		 557 aa  48.9  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.507024  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  27.4 
 
 		 437 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  26.11 
 
 		 665 aa  46.2  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  23.28 
 
 		 743 aa  45.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  30.11 
 
 		 299 aa  44.7  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>