97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0957 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0957  DnaB-like helicase-like  100 
 
 
469 aa  947    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0802  DnaB-like helicase-like  47.66 
 
 
557 aa  411  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.507024  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0261  hypothetical protein  25.65 
 
 
320 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1595  replicative DNA helicase  22.57 
 
 
476 aa  67.4  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  25.63 
 
 
509 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1320  DnaB domain-containing protein  22.52 
 
 
470 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0545947  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0982  replicative DNA helicase  24.89 
 
 
466 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0681  replicative DNA helicase  27.06 
 
 
470 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0995  replicative DNA helicase  24.79 
 
 
485 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.923932  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  25.99 
 
 
470 aa  58.9  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  25.82 
 
 
459 aa  57  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0375  replicative DNA helicase  21.67 
 
 
483 aa  57  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  21.38 
 
 
453 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1223  replicative DNA helicase  27.12 
 
 
461 aa  54.3  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728148  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  22.43 
 
 
441 aa  53.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  23.35 
 
 
460 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1371  replicative DNA helicase  26.79 
 
 
460 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3529  replicative DNA helicase  22.03 
 
 
593 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449592  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  26.07 
 
 
478 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0111  replicative DNA helicase  25.31 
 
 
455 aa  52.4  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  21.63 
 
 
453 aa  52  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  21.54 
 
 
450 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0667  replicative DNA helicase  24.55 
 
 
458 aa  51.2  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.486749  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0587  replicative DNA helicase  24.55 
 
 
458 aa  51.2  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.198545  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0136  DNA repair protein RadA  26.27 
 
 
456 aa  50.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000364921  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  22.9 
 
 
440 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  25.29 
 
 
679 aa  50.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  25.74 
 
 
445 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  26.99 
 
 
454 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  21.25 
 
 
476 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  21.65 
 
 
844 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  24.38 
 
 
456 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  21.96 
 
 
444 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0023  cpp26  29.23 
 
 
597 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.85156  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  21.88 
 
 
454 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  22.58 
 
 
461 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  24.29 
 
 
441 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  21.58 
 
 
476 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  22.22 
 
 
439 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  23.11 
 
 
448 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  38.36 
 
 
456 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  23.97 
 
 
446 aa  48.9  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0357  replicative DNA helicase  21.61 
 
 
465 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.973101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  21.65 
 
 
468 aa  48.5  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  22.92 
 
 
513 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  21.07 
 
 
451 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  21.07 
 
 
451 aa  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4942  replicative DNA helicase  23.7 
 
 
939 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  22.77 
 
 
696 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  26.79 
 
 
445 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4657  DnaB domain-containing protein  23.26 
 
 
824 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.186052  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2007  replicative DNA helicase  23.61 
 
 
458 aa  48.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  23.81 
 
 
292 aa  47.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1347  replicative DNA helicase  23.42 
 
 
458 aa  47.4  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1720  replicative DNA helicase  23.42 
 
 
458 aa  47.4  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  21.94 
 
 
903 aa  47.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  19.75 
 
 
455 aa  47  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1073  replicative DNA helicase  24.17 
 
 
539 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00005629  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  21.25 
 
 
471 aa  46.6  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  21.25 
 
 
471 aa  46.6  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3564  hypothetical protein  21.83 
 
 
734 aa  46.6  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233058  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  23.27 
 
 
457 aa  46.6  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2176  DNA repair protein RadA  25.69 
 
 
434 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0041  replicative DNA helicase  21.5 
 
 
585 aa  46.6  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  23.36 
 
 
474 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  22.82 
 
 
462 aa  46.6  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0550  replicative DNA helicase  24.46 
 
 
470 aa  46.2  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1531  DnaB helicase  28.22 
 
 
448 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498152  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3371  DnaB family helicase  22.37 
 
 
455 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  23.45 
 
 
456 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0023  DNA repair protein RadA  26.14 
 
 
444 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0179797  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  23.67 
 
 
292 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  23.81 
 
 
442 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3789  DNA repair protein RadA  23.96 
 
 
499 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  21.32 
 
 
459 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  25.82 
 
 
456 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  23.74 
 
 
442 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  23.27 
 
 
684 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  25.6 
 
 
452 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4838  replicative DNA helicase  22.34 
 
 
865 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  21.94 
 
 
453 aa  45.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5063  replicative DNA helicase  25.58 
 
 
871 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.946946  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  23.15 
 
 
454 aa  45.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0041  replicative DNA helicase  21.54 
 
 
514 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  19.01 
 
 
480 aa  44.3  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  26.11 
 
 
442 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  22.41 
 
 
472 aa  43.9  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  20.69 
 
 
449 aa  43.9  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2068  DnaB helicase  21.47 
 
 
466 aa  43.5  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1360  replicative DNA helicase  20.54 
 
 
473 aa  43.5  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  20.89 
 
 
462 aa  43.9  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  42.86 
 
 
452 aa  43.5  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  19.64 
 
 
451 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2278  replicative DNA helicase  24.56 
 
 
455 aa  43.5  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.467849  hitchhiker  0.000000922003 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  23.05 
 
 
471 aa  43.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  20.8 
 
 
457 aa  43.5  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03768  replicative DNA helicase  23.4 
 
 
384 aa  43.5  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000140287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>