More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0357 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0357  replicative DNA helicase  100 
 
 		 465 aa  951    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.973101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  48.87 
 
 		 473 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  47.49 
 
 		 469 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  48.42 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  48.42 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  45.64 
 
 		 464 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  47.51 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  47.4 
 
 		 477 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  45.64 
 
 		 464 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  46.29 
 
 		 468 aa  372  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  45 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  45.39 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  46.29 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  46.29 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  48.29 
 
 		 469 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  46.29 
 
 		 468 aa  372  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  44.77 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  45.62 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  45.62 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  47.84 
 
 		 468 aa  368  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  45.62 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  45.62 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  45.62 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  45.62 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1530  primary replicative DNA helicase  47.28 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000128037  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  46.1 
 
 		 476 aa  365  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  45.81 
 
 		 462 aa  365  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  45.62 
 
 		 468 aa  364  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  45.62 
 
 		 468 aa  364  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  46.1 
 
 		 476 aa  364  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  45.05 
 
 		 478 aa  363  4e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  44.71 
 
 		 466 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  46.21 
 
 		 468 aa  362  8e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  44.04 
 
 		 464 aa  362  9e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  46.43 
 
 		 468 aa  362  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  44.94 
 
 		 468 aa  360  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  43.81 
 
 		 463 aa  359  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  45.17 
 
 		 468 aa  359  6e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  44.39 
 
 		 472 aa  359  6e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  44.42 
 
 		 465 aa  358  8e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  46.96 
 
 		 473 aa  358  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  44.16 
 
 		 461 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  44.72 
 
 		 467 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  44.94 
 
 		 468 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  45.76 
 
 		 468 aa  355  6.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  45.93 
 
 		 470 aa  355  6.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3058  replicative DNA helicase  45.62 
 
 		 468 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000123089  normal  0.262766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  46.5 
 
 		 469 aa  355  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  45.56 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  45.43 
 
 		 465 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  45.8 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00018  replicative DNA helicase  44.93 
 
 		 466 aa  353  4e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  45.09 
 
 		 457 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  45.09 
 
 		 457 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 472 aa  351  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  43.35 
 
 		 464 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  43.35 
 
 		 464 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 474 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  43.95 
 
 		 466 aa  350  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 468 aa  350  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 468 aa  350  4e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  44.95 
 
 		 471 aa  349  5e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  44.95 
 
 		 471 aa  349  5e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 465 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 451 aa  349  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 465 aa  348  8e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  42.66 
 
 		 465 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2068  DnaB helicase  45.18 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 465 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  45.09 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  45.09 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  45.09 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  45.09 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  45.09 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  42.66 
 
 		 465 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  41.44 
 
 		 448 aa  345  8e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  45.01 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  45.01 
 
 		 471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  45.01 
 
 		 471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  45.01 
 
 		 471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  45.01 
 
 		 471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  45.01 
 
 		 471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  45.01 
 
 		 471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  45.01 
 
 		 471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  45.01 
 
 		 471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  44.44 
 
 		 463 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  41.9 
 
 		 441 aa  342  9e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  44.79 
 
 		 470 aa  342  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  44.22 
 
 		 462 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  44.22 
 
 		 462 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  42.99 
 
 		 459 aa  340  4e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0550  replicative DNA helicase  45.05 
 
 		 470 aa  339  5.9999999999999996e-92  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  44.12 
 
 		 473 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  45.89 
 
 		 463 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  42.36 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  43.89 
 
 		 461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  43.89 
 
 		 461 aa  336  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  42.66 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  42.5 
 
 		 462 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  43.99 
 
 		 462 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>