More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2068 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2068  DnaB helicase  100 
 
 		 466 aa  940    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0931  replicative DNA helicase  56.33 
 
 		 470 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000071326 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  48.17 
 
 		 472 aa  395  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  46.12 
 
 		 465 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  47.29 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  45.21 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  45.21 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  45.89 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  46.73 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  45.66 
 
 		 464 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  48.08 
 
 		 462 aa  388  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  45.66 
 
 		 464 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  47.96 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  46.7 
 
 		 463 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  43.37 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  46.35 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  44.29 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  46.92 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  46.92 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  45.23 
 
 		 473 aa  382  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  44.52 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  46.47 
 
 		 463 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  44.06 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  44.29 
 
 		 465 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  46.36 
 
 		 473 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  43.84 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  44.06 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  48.4 
 
 		 463 aa  378  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  44.77 
 
 		 472 aa  375  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  44.32 
 
 		 469 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  44.27 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  45.84 
 
 		 476 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  45.35 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  46.1 
 
 		 470 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  45.45 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  44.9 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  43.96 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  44.92 
 
 		 472 aa  368  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  45.76 
 
 		 476 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  45.23 
 
 		 472 aa  368  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  46.61 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  44.04 
 
 		 449 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  45.23 
 
 		 472 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  44.39 
 
 		 466 aa  362  9e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  44.3 
 
 		 471 aa  361  2e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  44.3 
 
 		 471 aa  361  2e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 462 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  41 
 
 		 468 aa  360  3e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 460 aa  360  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  41.46 
 
 		 468 aa  359  6e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  46.8 
 
 		 470 aa  359  6e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  44.3 
 
 		 469 aa  359  6e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  45.1 
 
 		 460 aa  359  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  40.54 
 
 		 468 aa  359  6e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  40.54 
 
 		 468 aa  359  6e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  44.19 
 
 		 461 aa  359  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0940  replicative DNA helicase  42.76 
 
 		 472 aa  358  9e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.68616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  40.32 
 
 		 468 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  44.19 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  43.51 
 
 		 471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  43.51 
 
 		 471 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  43.51 
 
 		 471 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  43.51 
 
 		 471 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  44.44 
 
 		 473 aa  357  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  43.51 
 
 		 471 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  43.51 
 
 		 471 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  43.48 
 
 		 468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  43.51 
 
 		 471 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.40263 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  43.51 
 
 		 471 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  44.65 
 
 		 460 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  40.55 
 
 		 468 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  40.77 
 
 		 468 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  40.77 
 
 		 468 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  40.77 
 
 		 468 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  40.77 
 
 		 468 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  44.65 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  43.28 
 
 		 471 aa  356  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  44.65 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  44.04 
 
 		 471 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  44.04 
 
 		 471 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  44.04 
 
 		 471 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  44.04 
 
 		 471 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  40.77 
 
 		 468 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  44.04 
 
 		 471 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  40.77 
 
 		 468 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  41.23 
 
 		 468 aa  355  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00018  replicative DNA helicase  44.62 
 
 		 466 aa  355  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  40.87 
 
 		 478 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1530  primary replicative DNA helicase  44.09 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000128037  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  42.82 
 
 		 468 aa  354  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>