More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03768 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03768  replicative DNA helicase  100 
 
 		 384 aa  773    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000140287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  82.41 
 
 		 478 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  70.42 
 
 		 468 aa  569  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  70.68 
 
 		 468 aa  570  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  70.42 
 
 		 468 aa  568  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  70.16 
 
 		 468 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  70.16 
 
 		 468 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  70.42 
 
 		 468 aa  569  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  69.37 
 
 		 468 aa  565  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  68.85 
 
 		 468 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  68.85 
 
 		 468 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  68.85 
 
 		 468 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  68.85 
 
 		 468 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  70.42 
 
 		 466 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  70.42 
 
 		 468 aa  558  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  68.59 
 
 		 468 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  67.54 
 
 		 468 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  67.02 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  68.85 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  69.63 
 
 		 468 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3058  replicative DNA helicase  69.11 
 
 		 468 aa  545  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000123089  normal  0.262766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  69.37 
 
 		 468 aa  544  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  68.59 
 
 		 468 aa  542  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  66.23 
 
 		 468 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  68.59 
 
 		 471 aa  537  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00018  replicative DNA helicase  70.16 
 
 		 466 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  68.32 
 
 		 471 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  68.32 
 
 		 471 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  68.06 
 
 		 470 aa  535  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  68.32 
 
 		 468 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  68.32 
 
 		 471 aa  536  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  68.32 
 
 		 451 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  68.32 
 
 		 471 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  68.06 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  68.32 
 
 		 471 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  68.32 
 
 		 468 aa  537  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  68.32 
 
 		 471 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  68.32 
 
 		 471 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  67.8 
 
 		 474 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  67.28 
 
 		 471 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  66.75 
 
 		 465 aa  533  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  67.28 
 
 		 471 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  67.28 
 
 		 471 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  67.28 
 
 		 471 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  67.28 
 
 		 471 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  65.97 
 
 		 472 aa  531  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0550  replicative DNA helicase  64.23 
 
 		 470 aa  496  1e-139  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  61.36 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0940  replicative DNA helicase  62.4 
 
 		 472 aa  485  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.68616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  59.42 
 
 		 464 aa  474  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  59.42 
 
 		 464 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  57.85 
 
 		 464 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  56.02 
 
 		 458 aa  455  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  55.76 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  55.76 
 
 		 464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  56.54 
 
 		 465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  55.76 
 
 		 465 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  54.97 
 
 		 464 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  56.02 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  55.76 
 
 		 465 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  56.02 
 
 		 465 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  56.02 
 
 		 463 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  54.07 
 
 		 462 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  54.71 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  54.71 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  54.59 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  53.54 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  52.49 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1083  replicative DNA helicase  54.4 
 
 		 610 aa  418  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.247036  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0931  replicative DNA helicase  54.4 
 
 		 610 aa  417  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  54.59 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  54.59 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  51.96 
 
 		 470 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  49.61 
 
 		 472 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1060  primary replicative DNA helicase  51.17 
 
 		 488 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  50.13 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  49.87 
 
 		 463 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  51.44 
 
 		 470 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  48.83 
 
 		 476 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  50.65 
 
 		 460 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  48.83 
 
 		 462 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  49.87 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  50.65 
 
 		 460 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  48.83 
 
 		 462 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  50.39 
 
 		 460 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  50.65 
 
 		 460 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  50.65 
 
 		 460 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  50.65 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  50.65 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  50.65 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  50.13 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  50.65 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  50.39 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  50.65 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0302  replicative DNA helicase  50.91 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1530  primary replicative DNA helicase  49.48 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000128037  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  46.88 
 
 		 473 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  50.65 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  50.65 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4115  replicative DNA helicase  50.52 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>