More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0681 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0681  replicative DNA helicase  100 
 
 
470 aa  964    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0982  replicative DNA helicase  64.07 
 
 
466 aa  610  1e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0667  replicative DNA helicase  57.24 
 
 
458 aa  527  1e-148  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.486749  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0587  replicative DNA helicase  57.24 
 
 
458 aa  527  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.198545  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1371  replicative DNA helicase  56.58 
 
 
460 aa  522  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1223  replicative DNA helicase  53.19 
 
 
461 aa  503  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728148  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0995  replicative DNA helicase  53.9 
 
 
485 aa  499  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.923932  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1595  replicative DNA helicase  50.88 
 
 
476 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0375  replicative DNA helicase  45.54 
 
 
483 aa  393  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  37.14 
 
 
465 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  37.45 
 
 
478 aa  277  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  36.36 
 
 
456 aa  274  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  35.41 
 
 
456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  37.34 
 
 
466 aa  273  7e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  32.9 
 
 
481 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  35.68 
 
 
458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  36.32 
 
 
460 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  35.39 
 
 
456 aa  266  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  36.11 
 
 
460 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  34.16 
 
 
464 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  34.1 
 
 
464 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  34.58 
 
 
461 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  34.1 
 
 
464 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  33.68 
 
 
468 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  34.24 
 
 
465 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  34.71 
 
 
468 aa  264  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  35 
 
 
468 aa  263  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  34.81 
 
 
456 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  34.45 
 
 
468 aa  263  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  34.49 
 
 
468 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  35 
 
 
468 aa  262  8e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  35 
 
 
468 aa  262  8e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  33.99 
 
 
442 aa  262  8.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  35.65 
 
 
449 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  34.79 
 
 
465 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  35.22 
 
 
468 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  34.29 
 
 
463 aa  262  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  33.48 
 
 
481 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  34.49 
 
 
468 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  35.73 
 
 
449 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  34.35 
 
 
465 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  34.78 
 
 
460 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  34.78 
 
 
460 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  34.78 
 
 
460 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  33.26 
 
 
468 aa  259  6e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  34.5 
 
 
460 aa  259  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  33.68 
 
 
464 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  34.14 
 
 
462 aa  259  7e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  34.5 
 
 
460 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  34.5 
 
 
460 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  34.5 
 
 
460 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  34.5 
 
 
460 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  34.5 
 
 
460 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  34.5 
 
 
460 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  33.41 
 
 
466 aa  259  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  33.54 
 
 
468 aa  259  8e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  34.5 
 
 
460 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  34.35 
 
 
465 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  33.84 
 
 
465 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  33.19 
 
 
472 aa  259  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  35.01 
 
 
470 aa  259  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  34.57 
 
 
460 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  34.57 
 
 
460 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  34.06 
 
 
468 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  34.06 
 
 
468 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  33.89 
 
 
474 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  33.47 
 
 
464 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  34.06 
 
 
468 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  34.06 
 
 
468 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  33.7 
 
 
509 aa  258  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  35.68 
 
 
449 aa  257  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  34.28 
 
 
461 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  33.19 
 
 
468 aa  256  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  34.28 
 
 
465 aa  256  5e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0940  replicative DNA helicase  34.56 
 
 
472 aa  256  6e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.68616  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  34.28 
 
 
462 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  34.06 
 
 
461 aa  256  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  34.42 
 
 
450 aa  256  9e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  33.41 
 
 
471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  33.99 
 
 
472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  34.49 
 
 
468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  32.39 
 
 
457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  33.62 
 
 
471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  33.41 
 
 
471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  33.41 
 
 
471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  33.41 
 
 
471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  33.41 
 
 
471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  33.41 
 
 
471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  33.41 
 
 
471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  33.41 
 
 
471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  34.11 
 
 
458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  33.9 
 
 
451 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  34.49 
 
 
468 aa  254  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  33.4 
 
 
461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  34.13 
 
 
460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  33.19 
 
 
470 aa  253  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  32.38 
 
 
460 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  34.2 
 
 
463 aa  253  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  33.98 
 
 
471 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  33.98 
 
 
471 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>