More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1320 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1320  DnaB domain-containing protein  100 
 
 		 470 aa  954    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0545947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3955  DnaB domain-containing protein  51.96 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.378441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3893  phage DNA helicase, putative  39.91 
 
 		 465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  35.07 
 
 		 476 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  33.71 
 
 		 476 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  33.86 
 
 		 471 aa  263  6e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  33.86 
 
 		 471 aa  263  6e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  35.6 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  34.09 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  34.53 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  35.32 
 
 		 464 aa  255  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  34.39 
 
 		 465 aa  256  9e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  35.32 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  35.71 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  34.4 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  35.48 
 
 		 464 aa  254  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  36.73 
 
 		 454 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  36.14 
 
 		 457 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  36.14 
 
 		 457 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  34.95 
 
 		 464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  33.04 
 
 		 460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  35.96 
 
 		 465 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  34.95 
 
 		 464 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  34.88 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  34 
 
 		 478 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  35.68 
 
 		 462 aa  249  7e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  34.3 
 
 		 472 aa  249  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  36.09 
 
 		 453 aa  248  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  33.85 
 
 		 446 aa  247  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  35.29 
 
 		 451 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  34.84 
 
 		 470 aa  246  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  35.25 
 
 		 470 aa  246  8e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  35.08 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  35.68 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  34.29 
 
 		 451 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  34.08 
 
 		 473 aa  244  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  34.29 
 
 		 468 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  34.29 
 
 		 468 aa  244  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  35.68 
 
 		 465 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  34.59 
 
 		 471 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  34.37 
 
 		 471 aa  243  5e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  34.37 
 
 		 471 aa  243  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  34.37 
 
 		 471 aa  243  5e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  34.37 
 
 		 471 aa  243  5e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  34.37 
 
 		 471 aa  243  5e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  35.68 
 
 		 465 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  35.32 
 
 		 457 aa  243  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  34.37 
 
 		 471 aa  243  5e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  32.07 
 
 		 468 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  32.07 
 
 		 468 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  32.29 
 
 		 468 aa  243  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  32.07 
 
 		 468 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  32.07 
 
 		 468 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  32.35 
 
 		 458 aa  243  6e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  35.68 
 
 		 465 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  34.37 
 
 		 471 aa  242  9e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  32.07 
 
 		 468 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  34.15 
 
 		 471 aa  242  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  32.29 
 
 		 468 aa  242  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  32.13 
 
 		 447 aa  242  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  32.07 
 
 		 468 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  32.07 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  34.01 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  35.11 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  31.85 
 
 		 468 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  31.85 
 
 		 468 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  32.29 
 
 		 468 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  34.46 
 
 		 460 aa  240  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  32.29 
 
 		 468 aa  240  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  33.78 
 
 		 467 aa  240  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  33.03 
 
 		 465 aa  240  5e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  36.28 
 
 		 452 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  34.44 
 
 		 468 aa  239  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  34.69 
 
 		 457 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  33.63 
 
 		 472 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  33.33 
 
 		 466 aa  239  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  34.44 
 
 		 468 aa  239  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  33.11 
 
 		 468 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  35.71 
 
 		 469 aa  237  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  35.15 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  33.33 
 
 		 468 aa  236  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  34.01 
 
 		 462 aa  236  6e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  32.07 
 
 		 468 aa  236  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  34.09 
 
 		 452 aa  236  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  34.25 
 
 		 452 aa  236  8e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  34.37 
 
 		 471 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  33.33 
 
 		 444 aa  236  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  34.37 
 
 		 471 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  34.37 
 
 		 471 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  34.37 
 
 		 471 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  34.37 
 
 		 471 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2278  replicative DNA helicase  35.94 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.467849  hitchhiker  0.000000922003 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  32.29 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  34.16 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  34.63 
 
 		 462 aa  234  3e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0940  replicative DNA helicase  33.18 
 
 		 472 aa  233  5e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.68616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  33.63 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  34.45 
 
 		 460 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  34.32 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  33.18 
 
 		 440 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>