More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0375 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0375  replicative DNA helicase  100 
 
 		 483 aa  986    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1595  replicative DNA helicase  59.38 
 
 		 476 aa  608  1e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0982  replicative DNA helicase  50.78 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0681  replicative DNA helicase  45.54 
 
 		 470 aa  415  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1223  replicative DNA helicase  47.2 
 
 		 461 aa  408  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728148  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0667  replicative DNA helicase  45.9 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.486749  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0587  replicative DNA helicase  45.9 
 
 		 458 aa  403  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.198545  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1371  replicative DNA helicase  45.45 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0995  replicative DNA helicase  45.58 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.923932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  39.25 
 
 		 456 aa  317  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  38.88 
 
 		 456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  39.65 
 
 		 476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  38.16 
 
 		 458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  37.83 
 
 		 465 aa  306  7e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  40.13 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  38.48 
 
 		 454 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58990  putative DNA helicase  37.94 
 
 		 448 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144919  normal  0.0290117 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  39.38 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  39.38 
 
 		 453 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  39.38 
 
 		 453 aa  302  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  39.38 
 
 		 453 aa  302  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  39.38 
 
 		 453 aa  302  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  39.38 
 
 		 453 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  39.38 
 
 		 453 aa  302  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  39.16 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  39.16 
 
 		 449 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  38.93 
 
 		 454 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  40.36 
 
 		 449 aa  300  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  39.12 
 
 		 453 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  40.13 
 
 		 449 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  37.5 
 
 		 459 aa  298  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  38.33 
 
 		 469 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  38.25 
 
 		 476 aa  297  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4223  primary replicative DNA helicase  37.55 
 
 		 456 aa  297  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  0.367922 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  36.92 
 
 		 471 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  37.56 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  36.18 
 
 		 443 aa  295  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  38.11 
 
 		 456 aa  295  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  40.13 
 
 		 449 aa  294  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  37.28 
 
 		 444 aa  294  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  37.28 
 
 		 439 aa  294  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  36.7 
 
 		 471 aa  292  7e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  36.7 
 
 		 471 aa  292  7e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  37.5 
 
 		 508 aa  292  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  36.7 
 
 		 471 aa  292  7e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  36.7 
 
 		 471 aa  292  7e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  36.7 
 
 		 471 aa  292  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  36.7 
 
 		 471 aa  292  7e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  36.48 
 
 		 471 aa  292  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  37.22 
 
 		 473 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  37.97 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  36.48 
 
 		 471 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  38.44 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  37 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  37 
 
 		 469 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  37 
 
 		 472 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  36.75 
 
 		 471 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  36.75 
 
 		 471 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  37.89 
 
 		 446 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  37.8 
 
 		 466 aa  290  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0905  replicative DNA helicase  37.69 
 
 		 479 aa  289  6e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000163785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  35.75 
 
 		 468 aa  289  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  36.9 
 
 		 478 aa  290  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  37.8 
 
 		 466 aa  290  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  35.95 
 
 		 468 aa  289  7e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4444  replicative DNA helicase  36.42 
 
 		 447 aa  289  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  36.04 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  35.75 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  36.42 
 
 		 451 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  36.42 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  36.42 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  35.82 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  35.82 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  36.84 
 
 		 468 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  35.82 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  37.61 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  36.64 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  37.8 
 
 		 460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  36.64 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  36.64 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  36.64 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0959  primary replicative DNA helicase  37.47 
 
 		 467 aa  286  4e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  36.18 
 
 		 471 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  36.18 
 
 		 471 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  36.18 
 
 		 471 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1459  replicative DNA helicase  37.47 
 
 		 467 aa  286  4e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  36.18 
 
 		 471 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  36.18 
 
 		 471 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  35.82 
 
 		 470 aa  286  5e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  35.6 
 
 		 468 aa  286  7e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  35.54 
 
 		 468 aa  286  8e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  37.33 
 
 		 466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  34.73 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  37.44 
 
 		 472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  36.4 
 
 		 465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  37.44 
 
 		 472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  36.36 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  36.04 
 
 		 474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  35.4 
 
 		 448 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  36.2 
 
 		 468 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>