More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1595 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1595  replicative DNA helicase  100 
 
 
476 aa  976    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0375  replicative DNA helicase  59.38 
 
 
483 aa  581  1e-164  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0681  replicative DNA helicase  50.88 
 
 
470 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0982  replicative DNA helicase  53.35 
 
 
466 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0667  replicative DNA helicase  48.37 
 
 
458 aa  430  1e-119  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.486749  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0587  replicative DNA helicase  48.37 
 
 
458 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.198545  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1371  replicative DNA helicase  47.93 
 
 
460 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0995  replicative DNA helicase  48.68 
 
 
485 aa  414  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.923932  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1223  replicative DNA helicase  45.37 
 
 
461 aa  411  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728148  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  39.18 
 
 
471 aa  323  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  39.18 
 
 
471 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  39.18 
 
 
471 aa  322  9.000000000000001e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  39.18 
 
 
471 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  39.18 
 
 
471 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  39.18 
 
 
471 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  39.18 
 
 
471 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  39.18 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  38.96 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  39.18 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  39.18 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  39.18 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  39.18 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  38.96 
 
 
471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  39.56 
 
 
466 aa  320  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  38.96 
 
 
468 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  38.53 
 
 
468 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  38.53 
 
 
468 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  38.53 
 
 
468 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  38.96 
 
 
468 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  40.48 
 
 
478 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  38.07 
 
 
465 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  38.31 
 
 
468 aa  316  6e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  39.09 
 
 
468 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  39.18 
 
 
472 aa  315  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  38.74 
 
 
468 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  38.1 
 
 
468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  39.31 
 
 
468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  39.31 
 
 
468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  40.8 
 
 
442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  39.31 
 
 
468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  39.31 
 
 
468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  38.1 
 
 
465 aa  313  4.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  37.83 
 
 
470 aa  312  6.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  38.53 
 
 
468 aa  311  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  39.29 
 
 
457 aa  311  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  38.53 
 
 
468 aa  311  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  38.53 
 
 
468 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  38.31 
 
 
451 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  39.11 
 
 
456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  38.44 
 
 
468 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  38.67 
 
 
456 aa  310  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  38.53 
 
 
466 aa  310  4e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  39.29 
 
 
461 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  37.45 
 
 
467 aa  310  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  39.31 
 
 
508 aa  310  4e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  39.82 
 
 
476 aa  310  5e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  39.52 
 
 
451 aa  309  9e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  39.52 
 
 
451 aa  309  9e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  40.04 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  39.34 
 
 
446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  40.35 
 
 
449 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  40.13 
 
 
449 aa  307  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  38.23 
 
 
456 aa  307  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  38.19 
 
 
458 aa  307  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  37.45 
 
 
468 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  37.88 
 
 
474 aa  306  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  37.23 
 
 
468 aa  305  9.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  37.45 
 
 
468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  37.66 
 
 
468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  39.69 
 
 
449 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  38.46 
 
 
445 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1459  replicative DNA helicase  36.9 
 
 
467 aa  302  7.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0959  primary replicative DNA helicase  36.9 
 
 
467 aa  302  8.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  39.25 
 
 
465 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  39.16 
 
 
476 aa  302  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3058  replicative DNA helicase  37.88 
 
 
468 aa  302  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000123089  normal  0.262766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  39.04 
 
 
465 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  39.04 
 
 
465 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  35.84 
 
 
461 aa  301  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  37.89 
 
 
463 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  40.4 
 
 
458 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  38.02 
 
 
453 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  38.68 
 
 
465 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  38.21 
 
 
451 aa  300  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  39.29 
 
 
446 aa  299  8e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  37.15 
 
 
446 aa  299  9e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  36.78 
 
 
441 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  38.5 
 
 
454 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  38.68 
 
 
443 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00018  replicative DNA helicase  38.1 
 
 
466 aa  298  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  37.01 
 
 
481 aa  297  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  38.02 
 
 
464 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  37.36 
 
 
453 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  37.36 
 
 
453 aa  297  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  37.36 
 
 
453 aa  297  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  37.36 
 
 
453 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  37.36 
 
 
453 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0905  replicative DNA helicase  36.17 
 
 
479 aa  297  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000163785  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  37.36 
 
 
453 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  37.8 
 
 
464 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>