35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0961 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  761    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  41.47 
 
 
387 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  46.35 
 
 
407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  36.02 
 
 
569 aa  186  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  34.29 
 
 
590 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  34.11 
 
 
466 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  33.78 
 
 
756 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  35 
 
 
647 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  33.09 
 
 
421 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  32.86 
 
 
681 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  33.09 
 
 
681 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  33.62 
 
 
358 aa  119  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  34.48 
 
 
362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  32.69 
 
 
367 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  32.77 
 
 
678 aa  104  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  29.29 
 
 
679 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  30.53 
 
 
370 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  26.76 
 
 
759 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  28.57 
 
 
454 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  25.68 
 
 
728 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  31.86 
 
 
464 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  27.49 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  27.8 
 
 
717 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  25.75 
 
 
404 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  40 
 
 
437 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2139  ATPase-like protein  27.13 
 
 
642 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.51863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2522  hypothetical protein  26.7 
 
 
487 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694376  normal  0.231254 
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  25.13 
 
 
718 aa  47  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1886  hypothetical protein  27.31 
 
 
396 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  23.12 
 
 
587 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  25.6 
 
 
797 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  30.43 
 
 
665 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2918  hypothetical protein  25.77 
 
 
366 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2962  hypothetical protein  25.77 
 
 
366 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3071  hypothetical protein  27.04 
 
 
366 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>