30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4150 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  771    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  62.96 
 
 
404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  56.12 
 
 
454 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  54.43 
 
 
759 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  54.78 
 
 
728 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  28.35 
 
 
590 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  33.56 
 
 
756 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  26.95 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  28.14 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  29.07 
 
 
717 aa  79.7  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  28.05 
 
 
466 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.32 
 
 
681 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.32 
 
 
681 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  25.74 
 
 
678 aa  77  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  28.68 
 
 
679 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  28.46 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  33.68 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  28.32 
 
 
569 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  27.08 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  27.49 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  31.36 
 
 
647 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  24.77 
 
 
367 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  26.6 
 
 
358 aa  62.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  27.27 
 
 
667 aa  50.4  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  29.66 
 
 
666 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1886  hypothetical protein  30.73 
 
 
396 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  34.21 
 
 
665 aa  46.2  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  27.51 
 
 
464 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  26.13 
 
 
796 aa  43.5  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1337  replicative DNA helicase  23.71 
 
 
450 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>