41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4830 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  832    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  46.55 
 
 		 375 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  39.5 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  34.95 
 
 		 590 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  37.55 
 
 		 756 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  37.3 
 
 		 569 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  34.87 
 
 		 681 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  34.87 
 
 		 681 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  30.03 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  36.4 
 
 		 466 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  36.64 
 
 		 421 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  32.86 
 
 		 678 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  27.81 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  26.29 
 
 		 679 aa  111  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  32.93 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  31.72 
 
 		 647 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  31.18 
 
 		 717 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  31.56 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  34.91 
 
 		 464 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  26.54 
 
 		 404 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  26.95 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  26.02 
 
 		 759 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  27.78 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  26.22 
 
 		 728 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  37.86 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  28.57 
 
 		 587 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2522  hypothetical protein  25.22 
 
 		 487 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694376  normal  0.231254 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  32.26 
 
 		 299 aa  57  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1854  hypothetical protein  26.67 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  hitchhiker  0.00705867 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1886  hypothetical protein  27.57 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  25.27 
 
 		 741 aa  53.1  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  26.4 
 
 		 718 aa  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2139  ATPase-like protein  23.98 
 
 		 642 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.51863 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0127  ATPase-like protein  29.65 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2962  hypothetical protein  24.27 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2918  hypothetical protein  24.27 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3071  hypothetical protein  24.63 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  27.03 
 
 		 665 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  25.15 
 
 		 654 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  32.84 
 
 		 796 aa  44.3  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  25.57 
 
 		 667 aa  43.5  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>