20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1886 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1886  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  791    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  27.57 
 
 
407 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  29.09 
 
 
404 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  29.07 
 
 
728 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  28.08 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  30.73 
 
 
382 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  27.31 
 
 
375 aa  47  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  27.32 
 
 
718 aa  46.6  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  25 
 
 
720 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0543  hypothetical protein  26.62 
 
 
286 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  27.03 
 
 
759 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  25.21 
 
 
682 aa  43.9  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  31.36 
 
 
466 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  31.36 
 
 
466 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  25.95 
 
 
712 aa  43.5  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3156  hypothetical protein  27.95 
 
 
640 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0060  hypothetical protein  25.61 
 
 
368 aa  43.1  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306635  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  27.1 
 
 
712 aa  43.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  27.1 
 
 
712 aa  43.1  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  31.45 
 
 
466 aa  42.7  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>