79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2776 on replicon NC_012036
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  100 
 
 		 718 aa  1471    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0060  hypothetical protein  33.55 
 
 		 368 aa  151  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3494  hypothetical protein  30.79 
 
 		 404 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000189556  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3071  hypothetical protein  34.52 
 
 		 366 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2962  hypothetical protein  34.52 
 
 		 366 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2918  hypothetical protein  34.52 
 
 		 366 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  29.59 
 
 		 697 aa  89  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0543  hypothetical protein  28.87 
 
 		 286 aa  85.9  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  27.42 
 
 		 449 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  28.57 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0583  hypothetical protein  26.95 
 
 		 225 aa  56.2  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.252034  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2522  hypothetical protein  26.64 
 
 		 487 aa  56.2  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694376  normal  0.231254 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0525  DNA repair protein RadA  25.64 
 
 		 446 aa  56.2  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  25.64 
 
 		 446 aa  56.2  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  25.64 
 
 		 446 aa  56.2  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  25.58 
 
 		 696 aa  55.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4322  hypothetical protein  22.68 
 
 		 811 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  26.62 
 
 		 453 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  25.97 
 
 		 454 aa  52.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0776  DNA repair protein RadA  28.66 
 
 		 448 aa  52  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  27.78 
 
 		 457 aa  52  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0589  hypothetical protein  33.94 
 
 		 196 aa  52  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.672583  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2458  DNA repair protein RadA  27.27 
 
 		 450 aa  51.6  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  27.27 
 
 		 451 aa  51.2  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  25.84 
 
 		 279 aa  51.2  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1183  DNA repair protein RadA  23.27 
 
 		 447 aa  51.2  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  27.92 
 
 		 451 aa  50.8  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1432  DNA repair protein RadA  29.56 
 
 		 458 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  24.03 
 
 		 470 aa  50.1  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  26.4 
 
 		 407 aa  49.7  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1111  DNA repair protein RadA  26.56 
 
 		 457 aa  49.7  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  23.38 
 
 		 457 aa  49.7  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  28.92 
 
 		 454 aa  49.3  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  23.92 
 
 		 684 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  27.42 
 
 		 464 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  26.92 
 
 		 452 aa  48.9  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  26.07 
 
 		 248 aa  48.5  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0136  DNA repair protein RadA  25.32 
 
 		 456 aa  48.9  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000364921  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  30.94 
 
 		 456 aa  48.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  25.95 
 
 		 463 aa  48.5  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  29.66 
 
 		 456 aa  48.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  30.25 
 
 		 271 aa  47.8  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  24.84 
 
 		 461 aa  47.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  29.66 
 
 		 456 aa  47.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2616  AAA ATPase  25.45 
 
 		 674 aa  47.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  24.83 
 
 		 590 aa  47.4  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  25.13 
 
 		 375 aa  47.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1134  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 347 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000316036  hitchhiker  0.00966616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3156  hypothetical protein  23.03 
 
 		 640 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  22.1 
 
 		 621 aa  47.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4298  DNA repair protein RadA  24.18 
 
 		 455 aa  46.6  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  25 
 
 		 299 aa  46.2  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  23.32 
 
 		 665 aa  46.2  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  25.81 
 
 		 277 aa  46.6  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  28.06 
 
 		 759 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  28.57 
 
 		 453 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  31.03 
 
 		 796 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  27.74 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1210  DNA repair protein RadA  23.35 
 
 		 446 aa  45.4  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.651562  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  24.4 
 
 		 495 aa  45.8  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0880  DNA repair protein RadA  25.66 
 
 		 450 aa  45.8  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.510643  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  26.62 
 
 		 455 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  24.68 
 
 		 408 aa  45.4  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  27.72 
 
 		 459 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  27.72 
 
 		 459 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1886  hypothetical protein  27.17 
 
 		 396 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0127  ATPase-like protein  23.62 
 
 		 389 aa  45.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  29.63 
 
 		 667 aa  45.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  23.38 
 
 		 459 aa  45.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  28.95 
 
 		 267 aa  45.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  23.65 
 
 		 448 aa  44.7  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1064  DNA repair protein RadA  23.32 
 
 		 452 aa  45.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1204  DNA repair protein RadA  26.75 
 
 		 457 aa  44.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0864  DNA repair protein RadA  27.4 
 
 		 448 aa  44.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1443  DNA repair protein RadA  25.11 
 
 		 454 aa  44.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1179  DNA repair protein RadA  25 
 
 		 457 aa  44.7  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.595072 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  26.98 
 
 		 682 aa  44.3  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  23.57 
 
 		 458 aa  44.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  23.91 
 
 		 520 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>