19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2616 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2616  AAA ATPase  100 
 
 		 674 aa  1390    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  29.03 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1111  DNA repair protein RadA  22.31 
 
 		 457 aa  49.3  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  27.01 
 
 		 367 aa  47.8  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  25.45 
 
 		 718 aa  47.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  23.92 
 
 		 477 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  25.36 
 
 		 466 aa  46.6  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  22.36 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3996  hypothetical protein  28.4 
 
 		 396 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  28.33 
 
 		 292 aa  46.6  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4092  DNA repair protein RadA  23.64 
 
 		 455 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0525  DNA repair protein RadA  22.94 
 
 		 446 aa  45.8  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  21.74 
 
 		 461 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  23.96 
 
 		 457 aa  45.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  21.37 
 
 		 453 aa  45.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  27.23 
 
 		 741 aa  44.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0778  DNA repair protein RadA  21.4 
 
 		 454 aa  43.9  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  29.78 
 
 		 569 aa  43.9  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  23.44 
 
 		 456 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>