16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2918 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2918  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  744    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2962  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  744    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3071  hypothetical protein  98.63 
 
 
366 aa  733    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3494  hypothetical protein  40.69 
 
 
404 aa  199  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000189556  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0060  hypothetical protein  41.31 
 
 
368 aa  199  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306635  normal 
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  34.52 
 
 
718 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0543  hypothetical protein  34.29 
 
 
286 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  23.22 
 
 
367 aa  53.5  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  25.24 
 
 
590 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  24.34 
 
 
654 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  24.63 
 
 
407 aa  46.6  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  22.75 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  25.77 
 
 
375 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  27.03 
 
 
741 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  25.99 
 
 
292 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  28.73 
 
 
279 aa  42.7  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>