28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3156 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3156  hypothetical protein  100 
 
 
640 aa  1322    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4322  hypothetical protein  26.9 
 
 
811 aa  80.5  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1695  hypothetical protein  27.64 
 
 
415 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.385002  normal  0.0131506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  27.01 
 
 
621 aa  65.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  25.75 
 
 
665 aa  63.9  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0127  ATPase-like protein  28.57 
 
 
389 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2139  ATPase-like protein  28.05 
 
 
642 aa  61.2  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.51863 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2245  hypothetical protein  28.32 
 
 
631 aa  56.2  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.67793  normal  0.307121 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  28.66 
 
 
654 aa  55.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  24.66 
 
 
796 aa  53.9  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  25 
 
 
452 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  26.24 
 
 
453 aa  52  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  26.24 
 
 
453 aa  51.6  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1724  putative DNA helicase  26.6 
 
 
294 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  26.96 
 
 
455 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  26.11 
 
 
457 aa  47.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  23.03 
 
 
718 aa  47.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  24.53 
 
 
476 aa  47.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  23.27 
 
 
358 aa  47.4  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  26.5 
 
 
720 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  24.67 
 
 
408 aa  47  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  23.53 
 
 
461 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  26.34 
 
 
453 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  26.03 
 
 
453 aa  45.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  26.29 
 
 
590 aa  45.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  25.99 
 
 
283 aa  44.3  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  24.65 
 
 
477 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  22.28 
 
 
647 aa  43.9  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>