53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0127 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0127  ATPase-like protein  100 
 
 		 389 aa  785    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  53.76 
 
 		 796 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  46.55 
 
 		 665 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  45.57 
 
 		 621 aa  267  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2129  ATPase-like protein  31.38 
 
 		 465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3156  hypothetical protein  28.57 
 
 		 640 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  43.37 
 
 		 654 aa  73.2  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  47.44 
 
 		 667 aa  70.1  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  28.71 
 
 		 743 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  26.59 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  38.39 
 
 		 716 aa  63.2  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  29.65 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  41.33 
 
 		 759 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0355  hypothetical protein  27.81 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0426919  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  28.51 
 
 		 712 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  28.51 
 
 		 712 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  28.51 
 
 		 712 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  28.51 
 
 		 712 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  23.94 
 
 		 719 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  29.56 
 
 		 720 aa  57.4  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  24.73 
 
 		 741 aa  57  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  23.62 
 
 		 718 aa  56.6  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  23.61 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  26.17 
 
 		 279 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  36.84 
 
 		 682 aa  53.9  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4165  hypothetical protein  25 
 
 		 842 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3116  hypothetical protein  24.89 
 
 		 841 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  26.29 
 
 		 731 aa  52  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  28.42 
 
 		 679 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  25.53 
 
 		 647 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  26.18 
 
 		 797 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  32.65 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  28.15 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2513  hypothetical protein  27.43 
 
 		 536 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450265 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  26.61 
 
 		 299 aa  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  27.31 
 
 		 248 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1283  AAA ATPase  26.35 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261303  normal  0.841625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.68 
 
 		 681 aa  46.6  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  29.9 
 
 		 375 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.68 
 
 		 681 aa  46.6  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4351  hypothetical protein  28.79 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215694 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2712  hypothetical protein  31.09 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  27.54 
 
 		 466 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  29.49 
 
 		 590 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2671  hypothetical protein  37.5 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00889108  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1207  DNA repair protein RadA  26.72 
 
 		 458 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  24.17 
 
 		 292 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0309  DNA repair protein RadA  27.75 
 
 		 465 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.503927  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0215  hypothetical protein  25.64 
 
 		 445 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.203001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  26.13 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2969  hypothetical protein  29.44 
 
 		 412 aa  43.5  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  34.18 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4322  hypothetical protein  23.16 
 
 		 811 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>