18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1283 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1283  AAA ATPase  100 
 
 
392 aa  800    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261303  normal  0.841625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4351  hypothetical protein  52.19 
 
 
395 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215694 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  52.35 
 
 
797 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2969  hypothetical protein  47.84 
 
 
412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3697  TOPRIM  40.83 
 
 
512 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.779758  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3667  hypothetical protein  37.57 
 
 
518 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333104  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2513  hypothetical protein  27.27 
 
 
536 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450265 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1388  hypothetical protein  34.97 
 
 
206 aa  62.4  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  25.4 
 
 
665 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0127  ATPase-like protein  26.36 
 
 
389 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  29.31 
 
 
499 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2671  hypothetical protein  28.69 
 
 
352 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00889108  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  33.63 
 
 
498 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  25 
 
 
667 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  29.33 
 
 
452 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  27.59 
 
 
506 aa  43.9  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  22.47 
 
 
358 aa  43.5  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  25.54 
 
 
299 aa  43.1  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.315744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>