More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2373 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0323  replicative DNA helicase  82.38 
 
 		 496 aa  798    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1928  replicative DNA helicase  83.72 
 
 		 496 aa  797    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.671087  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1740  replicative DNA helicase  70.34 
 
 		 501 aa  681    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.057325  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1778  replicative DNA helicase  77.62 
 
 		 505 aa  779    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0594772  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  100 
 
 		 506 aa  1024    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0579  replicative DNA helicase  83.51 
 
 		 496 aa  797    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  76.96 
 
 		 499 aa  751    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  60.72 
 
 		 498 aa  580  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  61.41 
 
 		 497 aa  578  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  59.41 
 
 		 497 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3494  replicative DNA helicase  57.73 
 
 		 498 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4412  replicative DNA helicase  58.2 
 
 		 495 aa  561  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3938  replicative DNA helicase  57.58 
 
 		 495 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.19512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4306  replicative DNA helicase  57.58 
 
 		 495 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337711  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2594  replicative DNA helicase  59.45 
 
 		 495 aa  551  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2458  replicative DNA helicase  56.1 
 
 		 498 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  58.21 
 
 		 493 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4633  replicative DNA helicase  59.28 
 
 		 495 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746602  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2991  replicative DNA helicase  56.29 
 
 		 498 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0987  replicative DNA helicase  56.62 
 
 		 496 aa  549  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326082  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5417  replicative DNA helicase  57.75 
 
 		 495 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  56.79 
 
 		 498 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0563  replicative DNA helicase  57.6 
 
 		 501 aa  542  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1515  replicative DNA helicase  57.08 
 
 		 498 aa  538  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  55.58 
 
 		 496 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0456  replicative DNA helicase  56.96 
 
 		 501 aa  538  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0450  replicative DNA helicase  56.96 
 
 		 501 aa  537  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.741231  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  56.44 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  55.99 
 
 		 496 aa  537  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3808  replicative DNA helicase  55.8 
 
 		 502 aa  535  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206642  normal  0.455208 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1209  replicative DNA helicase  56.05 
 
 		 494 aa  532  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1050  replicative DNA helicase  54.72 
 
 		 498 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1193  replicative DNA helicase  54.51 
 
 		 498 aa  525  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0321974  normal  0.164958 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  53.42 
 
 		 500 aa  513  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  54.03 
 
 		 493 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1848  replicative DNA helicase  53.8 
 
 		 504 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4055  replicative DNA helicase  50.41 
 
 		 504 aa  478  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0410  DnaB helicase  52.19 
 
 		 507 aa  472  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2873  replicative DNA helicase  52.61 
 
 		 494 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0142  replicative DNA helicase  50.53 
 
 		 504 aa  437  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0766  replicative DNA helicase  48.55 
 
 		 503 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0571  replicative DNA helicase  46.22 
 
 		 488 aa  398  1e-109  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0451  replicative DNA helicase  46.22 
 
 		 488 aa  396  1e-109  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  46.71 
 
 		 494 aa  391  1e-107  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0354  replicative DNA helicase  42.57 
 
 		 483 aa  385  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  44.74 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  42.02 
 
 		 461 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  39.83 
 
 		 457 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  39.83 
 
 		 457 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  40.34 
 
 		 456 aa  329  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  39.74 
 
 		 456 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  39.74 
 
 		 481 aa  323  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  39.11 
 
 		 449 aa  319  7e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  39.14 
 
 		 481 aa  318  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  38.3 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  37.71 
 
 		 448 aa  317  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  40.99 
 
 		 450 aa  316  5e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  39.1 
 
 		 460 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  38.16 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  37.18 
 
 		 466 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  38.19 
 
 		 449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  38.72 
 
 		 449 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  39.96 
 
 		 442 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  38.68 
 
 		 460 aa  312  1e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0940  replicative DNA helicase  40.64 
 
 		 472 aa  311  2e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.68616  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  38.33 
 
 		 456 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  37.61 
 
 		 466 aa  310  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  37.61 
 
 		 466 aa  310  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  39.96 
 
 		 461 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  37.12 
 
 		 476 aa  309  8e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  38.83 
 
 		 465 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  37.15 
 
 		 453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  37.15 
 
 		 453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  37.15 
 
 		 453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  37.15 
 
 		 453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  38.2 
 
 		 456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  37.15 
 
 		 453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  36.94 
 
 		 449 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  37.15 
 
 		 453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  37.15 
 
 		 453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  39.96 
 
 		 446 aa  307  3e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  38.4 
 
 		 456 aa  307  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  36.94 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  40.34 
 
 		 472 aa  306  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  37.92 
 
 		 470 aa  306  7e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1360  replicative DNA helicase  36.01 
 
 		 473 aa  306  8.000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  36.65 
 
 		 462 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  37.97 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  37.74 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  39.15 
 
 		 451 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27870  primary replicative DNA helicase  38.81 
 
 		 464 aa  305  2.0000000000000002e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0308941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  39.74 
 
 		 464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  39.32 
 
 		 464 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  39.74 
 
 		 464 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  38.89 
 
 		 470 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  39.1 
 
 		 464 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  36.05 
 
 		 476 aa  302  9e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  38.38 
 
 		 440 aa  302  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  40.25 
 
 		 472 aa  302  9e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  40.25 
 
 		 472 aa  302  9e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>