More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0410 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0410  DnaB helicase  100 
 
 		 507 aa  1031    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1848  replicative DNA helicase  57.59 
 
 		 504 aa  534  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3494  replicative DNA helicase  54.3 
 
 		 498 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2873  replicative DNA helicase  55.51 
 
 		 494 aa  504  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  54.12 
 
 		 497 aa  504  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2458  replicative DNA helicase  53.5 
 
 		 498 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2991  replicative DNA helicase  52.93 
 
 		 498 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  52.62 
 
 		 498 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0456  replicative DNA helicase  52.45 
 
 		 501 aa  496  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0563  replicative DNA helicase  52.45 
 
 		 501 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  49.4 
 
 		 500 aa  494  9.999999999999999e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0450  replicative DNA helicase  52.24 
 
 		 501 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.741231  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0987  replicative DNA helicase  53.11 
 
 		 496 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326082  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  52.33 
 
 		 498 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4633  replicative DNA helicase  52.65 
 
 		 495 aa  490  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746602  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3938  replicative DNA helicase  51.84 
 
 		 495 aa  490  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.19512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1515  replicative DNA helicase  52.45 
 
 		 498 aa  488  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  51.81 
 
 		 497 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2594  replicative DNA helicase  51.9 
 
 		 495 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4306  replicative DNA helicase  51.84 
 
 		 495 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337711  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4412  replicative DNA helicase  51.84 
 
 		 495 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  52.03 
 
 		 493 aa  491  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1928  replicative DNA helicase  53.78 
 
 		 496 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.671087  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0579  replicative DNA helicase  53.78 
 
 		 496 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1778  replicative DNA helicase  52.3 
 
 		 505 aa  486  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0594772  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3808  replicative DNA helicase  51.51 
 
 		 502 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206642  normal  0.455208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1193  replicative DNA helicase  50.7 
 
 		 498 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0321974  normal  0.164958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1050  replicative DNA helicase  50.5 
 
 		 498 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0323  replicative DNA helicase  54.07 
 
 		 496 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  51.95 
 
 		 499 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5417  replicative DNA helicase  51.12 
 
 		 495 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  52.19 
 
 		 506 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  50.83 
 
 		 496 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  49.9 
 
 		 496 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1740  replicative DNA helicase  51.42 
 
 		 501 aa  457  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.057325  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  50.83 
 
 		 499 aa  455  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0766  replicative DNA helicase  49.29 
 
 		 503 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  50.62 
 
 		 493 aa  438  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1209  replicative DNA helicase  49.38 
 
 		 494 aa  434  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4055  replicative DNA helicase  48.43 
 
 		 504 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0142  replicative DNA helicase  49.39 
 
 		 504 aa  428  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0451  replicative DNA helicase  44.31 
 
 		 488 aa  390  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0571  replicative DNA helicase  43.06 
 
 		 488 aa  387  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  44.42 
 
 		 494 aa  387  1e-106  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0354  replicative DNA helicase  43.37 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  45.45 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  43.22 
 
 		 448 aa  361  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  43.98 
 
 		 442 aa  359  6e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  43.6 
 
 		 446 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  41.5 
 
 		 453 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  43.51 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  40.82 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  40.82 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  40.82 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  40.82 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  41 
 
 		 446 aa  351  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  40.82 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  40.82 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  40.82 
 
 		 453 aa  351  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  41.49 
 
 		 449 aa  348  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  40.62 
 
 		 453 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  40.62 
 
 		 449 aa  348  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  41.72 
 
 		 440 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  40.7 
 
 		 449 aa  347  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  42.24 
 
 		 456 aa  346  6e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  42.62 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  41.08 
 
 		 449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  42 
 
 		 456 aa  343  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  41.04 
 
 		 442 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  40.79 
 
 		 443 aa  342  1e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  42.32 
 
 		 454 aa  342  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  41 
 
 		 454 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  42.17 
 
 		 456 aa  341  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  40.38 
 
 		 454 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  40.25 
 
 		 441 aa  340  5e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  40.41 
 
 		 456 aa  339  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  40 
 
 		 466 aa  336  5e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  40.51 
 
 		 466 aa  336  5.999999999999999e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  40.51 
 
 		 466 aa  336  5.999999999999999e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  40.42 
 
 		 460 aa  335  7.999999999999999e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1337  replicative DNA helicase  40.88 
 
 		 450 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  40.21 
 
 		 460 aa  333  4e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  40.67 
 
 		 444 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  42.48 
 
 		 481 aa  332  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  40.67 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  40.46 
 
 		 445 aa  329  6e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  40.58 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  41.46 
 
 		 450 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  40.12 
 
 		 458 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  39.08 
 
 		 463 aa  328  2.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21441  DnaB replicative helicase  40.64 
 
 		 472 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1273  DnaB replicative helicase  40.87 
 
 		 472 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  40.12 
 
 		 450 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  41.82 
 
 		 444 aa  326  7e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  40.61 
 
 		 459 aa  325  9e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  40.54 
 
 		 453 aa  325  9e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  40.04 
 
 		 465 aa  325  9e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  39.26 
 
 		 476 aa  324  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  40.34 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  40.34 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>