More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0766 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4055  replicative DNA helicase  64.99 
 
 		 504 aa  646    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0142  replicative DNA helicase  69.23 
 
 		 504 aa  653    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0766  replicative DNA helicase  100 
 
 		 503 aa  1020    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3494  replicative DNA helicase  52.23 
 
 		 498 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  50.6 
 
 		 497 aa  484  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3808  replicative DNA helicase  49.4 
 
 		 502 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206642  normal  0.455208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2458  replicative DNA helicase  50.71 
 
 		 498 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  51.21 
 
 		 498 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2991  replicative DNA helicase  50.81 
 
 		 498 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  51.23 
 
 		 499 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_004310  BR0450  replicative DNA helicase  50.31 
 
 		 501 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.741231  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  49.28 
 
 		 500 aa  466  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0456  replicative DNA helicase  50.31 
 
 		 501 aa  465  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1778  replicative DNA helicase  49.5 
 
 		 505 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0594772  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1515  replicative DNA helicase  49.69 
 
 		 498 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  50.63 
 
 		 493 aa  458  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0323  replicative DNA helicase  51.57 
 
 		 496 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1928  replicative DNA helicase  50.3 
 
 		 496 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.671087  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4633  replicative DNA helicase  50 
 
 		 495 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746602  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0579  replicative DNA helicase  50.3 
 
 		 496 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  50.83 
 
 		 497 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0563  replicative DNA helicase  49.9 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1050  replicative DNA helicase  49.8 
 
 		 498 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1193  replicative DNA helicase  49.69 
 
 		 498 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0321974  normal  0.164958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2594  replicative DNA helicase  49.8 
 
 		 495 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0987  replicative DNA helicase  48.69 
 
 		 496 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326082  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  49.9 
 
 		 498 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  48.88 
 
 		 496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3938  replicative DNA helicase  49.68 
 
 		 495 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.19512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4306  replicative DNA helicase  49.68 
 
 		 495 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337711  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0410  DnaB helicase  49.29 
 
 		 507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4412  replicative DNA helicase  49.68 
 
 		 495 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5417  replicative DNA helicase  48.48 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  48.55 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  48.68 
 
 		 496 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  49.05 
 
 		 499 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1848  replicative DNA helicase  47.28 
 
 		 504 aa  431  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  47.84 
 
 		 493 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1209  replicative DNA helicase  47.79 
 
 		 494 aa  415  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1740  replicative DNA helicase  46.84 
 
 		 501 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.057325  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2873  replicative DNA helicase  48.31 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0354  replicative DNA helicase  40.04 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  41.3 
 
 		 494 aa  365  1e-99  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0571  replicative DNA helicase  42.08 
 
 		 488 aa  351  1e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0451  replicative DNA helicase  41.63 
 
 		 488 aa  352  1e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  42.16 
 
 		 460 aa  346  6e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  37.63 
 
 		 446 aa  316  5e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  37.63 
 
 		 445 aa  309  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  36.71 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  37.74 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  37.74 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  37.74 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  37.74 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  37.74 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  37.74 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  37.74 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  37.32 
 
 		 449 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  37.32 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  40.67 
 
 		 512 aa  304  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  36.79 
 
 		 442 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  36.72 
 
 		 476 aa  301  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  36.9 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  39.26 
 
 		 471 aa  301  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27870  primary replicative DNA helicase  37.83 
 
 		 464 aa  300  3e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0308941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  38.25 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  39.88 
 
 		 525 aa  299  7e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  37.68 
 
 		 457 aa  299  7e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  37.68 
 
 		 457 aa  299  7e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  36.19 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  36.48 
 
 		 454 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  37.42 
 
 		 454 aa  297  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  36.92 
 
 		 448 aa  297  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  34.31 
 
 		 444 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  34.1 
 
 		 439 aa  296  8e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0041  replicative DNA helicase  39.55 
 
 		 514 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1337  replicative DNA helicase  36.72 
 
 		 450 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  37.4 
 
 		 472 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  37.66 
 
 		 443 aa  295  2e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  37.76 
 
 		 450 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  35.4 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  36.85 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  36.74 
 
 		 466 aa  293  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  36.74 
 
 		 466 aa  293  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  38.27 
 
 		 442 aa  293  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  35.4 
 
 		 464 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  36.61 
 
 		 466 aa  292  8e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  35.67 
 
 		 465 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  35.4 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  37.34 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  37.79 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  35.2 
 
 		 463 aa  290  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  36.96 
 
 		 447 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  35.4 
 
 		 464 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  35.4 
 
 		 464 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  38.16 
 
 		 446 aa  289  8e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  35.26 
 
 		 465 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  35.22 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  38.03 
 
 		 450 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  37.88 
 
 		 469 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  38.08 
 
 		 444 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>