More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4469 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1928  replicative DNA helicase  73.59 
 
 		 496 aa  730    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.671087  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  74.3 
 
 		 506 aa  736    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1778  replicative DNA helicase  71.37 
 
 		 505 aa  712    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0594772  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0579  replicative DNA helicase  73.39 
 
 		 496 aa  729    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  100 
 
 		 499 aa  1014    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0323  replicative DNA helicase  73.79 
 
 		 496 aa  731    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1740  replicative DNA helicase  62.85 
 
 		 501 aa  629  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.057325  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  57.2 
 
 		 498 aa  544  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  59.49 
 
 		 497 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  57.26 
 
 		 497 aa  531  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2594  replicative DNA helicase  57.94 
 
 		 495 aa  519  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3494  replicative DNA helicase  55.35 
 
 		 498 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0987  replicative DNA helicase  55.25 
 
 		 496 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326082  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  53.8 
 
 		 493 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0563  replicative DNA helicase  55.46 
 
 		 501 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2458  replicative DNA helicase  55.21 
 
 		 498 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2991  replicative DNA helicase  54.49 
 
 		 498 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4633  replicative DNA helicase  56.87 
 
 		 495 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746602  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4412  replicative DNA helicase  55.36 
 
 		 495 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1209  replicative DNA helicase  54.43 
 
 		 494 aa  506  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0450  replicative DNA helicase  54.6 
 
 		 501 aa  502  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.741231  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0456  replicative DNA helicase  54.6 
 
 		 501 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  54.62 
 
 		 498 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  53.93 
 
 		 499 aa  502  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5417  replicative DNA helicase  55.01 
 
 		 495 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4306  replicative DNA helicase  55.22 
 
 		 495 aa  504  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337711  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3938  replicative DNA helicase  55.22 
 
 		 495 aa  504  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.19512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1515  replicative DNA helicase  52.86 
 
 		 498 aa  498  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  53.65 
 
 		 496 aa  498  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  53.68 
 
 		 496 aa  498  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3808  replicative DNA helicase  53.67 
 
 		 502 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206642  normal  0.455208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1050  replicative DNA helicase  52.15 
 
 		 498 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1193  replicative DNA helicase  51.93 
 
 		 498 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0321974  normal  0.164958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  53.1 
 
 		 493 aa  474  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  49.69 
 
 		 500 aa  467  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1848  replicative DNA helicase  52.63 
 
 		 504 aa  458  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4055  replicative DNA helicase  49.79 
 
 		 504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0410  DnaB helicase  50.51 
 
 		 507 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2873  replicative DNA helicase  50.31 
 
 		 494 aa  430  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0766  replicative DNA helicase  48.65 
 
 		 503 aa  420  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0142  replicative DNA helicase  48.69 
 
 		 504 aa  414  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  44.7 
 
 		 460 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0354  replicative DNA helicase  42.19 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0571  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 488 aa  370  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0451  replicative DNA helicase  43.31 
 
 		 488 aa  371  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  44.23 
 
 		 494 aa  365  1e-100  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  43.56 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  41.15 
 
 		 457 aa  328  9e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  41.15 
 
 		 457 aa  328  9e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  39.32 
 
 		 481 aa  325  9e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  38.98 
 
 		 456 aa  323  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  38.77 
 
 		 456 aa  322  8e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  39.57 
 
 		 441 aa  320  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  41.58 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  40.13 
 
 		 465 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  39.92 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  39.74 
 
 		 470 aa  318  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  40.22 
 
 		 450 aa  316  7e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  39.5 
 
 		 464 aa  315  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0940  replicative DNA helicase  40.43 
 
 		 472 aa  315  9.999999999999999e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.68616  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  38.63 
 
 		 472 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  40.8 
 
 		 442 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  39.4 
 
 		 481 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  39.1 
 
 		 460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  39.32 
 
 		 446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  38.43 
 
 		 446 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  39.54 
 
 		 477 aa  312  6.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  40.46 
 
 		 472 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  38.68 
 
 		 460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  40.67 
 
 		 472 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  37.9 
 
 		 449 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  38.4 
 
 		 469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  40.67 
 
 		 472 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  40.34 
 
 		 469 aa  310  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  39.83 
 
 		 473 aa  310  5e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  38.92 
 
 		 456 aa  309  9e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  39.2 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  38.2 
 
 		 476 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  37.53 
 
 		 466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  38.99 
 
 		 464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1360  replicative DNA helicase  35.83 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  36.49 
 
 		 458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  38.92 
 
 		 449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  39.08 
 
 		 445 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  38.1 
 
 		 472 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  37.53 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  37.53 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  37.53 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  37.53 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  37.53 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  38.89 
 
 		 476 aa  307  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  37.53 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  37.45 
 
 		 442 aa  307  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  38.49 
 
 		 449 aa  307  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  37.53 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  37.73 
 
 		 453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  39.37 
 
 		 462 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  37.32 
 
 		 453 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  37.32 
 
 		 449 aa  306  7e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  39.19 
 
 		 446 aa  306  7e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>