More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2873 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2873  replicative DNA helicase  100 
 
 
494 aa  996    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1848  replicative DNA helicase  73.06 
 
 
504 aa  733    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0410  DnaB helicase  55.51 
 
 
507 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  55.28 
 
 
497 aa  508  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3494  replicative DNA helicase  52.36 
 
 
498 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0456  replicative DNA helicase  51.88 
 
 
501 aa  479  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1515  replicative DNA helicase  51.99 
 
 
498 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4306  replicative DNA helicase  51.64 
 
 
495 aa  478  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337711  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2458  replicative DNA helicase  52.2 
 
 
498 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0617569  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  51.51 
 
 
498 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2991  replicative DNA helicase  51.68 
 
 
498 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  51.93 
 
 
497 aa  480  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3938  replicative DNA helicase  51.64 
 
 
495 aa  478  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.19512 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  52.26 
 
 
498 aa  479  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  52.61 
 
 
506 aa  476  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0450  replicative DNA helicase  51.67 
 
 
501 aa  477  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.741231  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  51.44 
 
 
499 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0563  replicative DNA helicase  51.78 
 
 
501 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0987  replicative DNA helicase  52.2 
 
 
496 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326082  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4412  replicative DNA helicase  51.67 
 
 
495 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  50.7 
 
 
496 aa  472  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  48.89 
 
 
500 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4633  replicative DNA helicase  51.02 
 
 
495 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746602  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4055  replicative DNA helicase  50.61 
 
 
504 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1050  replicative DNA helicase  50.31 
 
 
498 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1193  replicative DNA helicase  50.21 
 
 
498 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0321974  normal  0.164958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  51.52 
 
 
493 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3808  replicative DNA helicase  49.7 
 
 
502 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206642  normal  0.455208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2594  replicative DNA helicase  50.83 
 
 
495 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1928  replicative DNA helicase  50.83 
 
 
496 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.671087  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  49.5 
 
 
496 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0579  replicative DNA helicase  50.83 
 
 
496 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0323  replicative DNA helicase  50.62 
 
 
496 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5417  replicative DNA helicase  50.1 
 
 
495 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131044  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1778  replicative DNA helicase  50.63 
 
 
505 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0594772  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  50.31 
 
 
499 aa  445  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1740  replicative DNA helicase  48.63 
 
 
501 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.057325  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  47.82 
 
 
493 aa  418  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0142  replicative DNA helicase  49.9 
 
 
504 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1209  replicative DNA helicase  47.17 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0766  replicative DNA helicase  48.31 
 
 
503 aa  413  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13273  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0354  replicative DNA helicase  42.14 
 
 
483 aa  376  1e-103  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  44 
 
 
460 aa  364  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  43.25 
 
 
494 aa  363  3e-99  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0571  replicative DNA helicase  41.09 
 
 
488 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0451  replicative DNA helicase  41.3 
 
 
488 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  41.34 
 
 
476 aa  335  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  41.16 
 
 
442 aa  335  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  41.63 
 
 
440 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  39.26 
 
 
448 aa  333  4e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  39.5 
 
 
449 aa  332  8e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  41.25 
 
 
476 aa  331  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  40.66 
 
 
454 aa  331  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  39.08 
 
 
449 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  42.2 
 
 
446 aa  329  8e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1337  replicative DNA helicase  40.67 
 
 
450 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  38.57 
 
 
446 aa  326  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  38.62 
 
 
454 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  37.71 
 
 
466 aa  323  4e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  41.41 
 
 
461 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  38.16 
 
 
453 aa  322  7e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  38.67 
 
 
456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  37.53 
 
 
466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  37.53 
 
 
466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  38.8 
 
 
444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  38.8 
 
 
444 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  39.09 
 
 
456 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  36.91 
 
 
453 aa  319  6e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  36.91 
 
 
453 aa  319  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  36.91 
 
 
453 aa  319  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  36.91 
 
 
453 aa  319  6e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  36.91 
 
 
453 aa  319  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  36.91 
 
 
453 aa  319  6e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  39.51 
 
 
460 aa  319  7e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  38.41 
 
 
454 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  36.91 
 
 
453 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  39.51 
 
 
460 aa  319  9e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  38.66 
 
 
449 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  36.49 
 
 
453 aa  318  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  36.49 
 
 
449 aa  318  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  37.34 
 
 
463 aa  317  3e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  40.57 
 
 
471 aa  317  3e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  38.36 
 
 
445 aa  317  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  40.57 
 
 
471 aa  317  3e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  40.25 
 
 
450 aa  316  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  40.21 
 
 
461 aa  315  9e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  38.72 
 
 
444 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  37.74 
 
 
442 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  39.46 
 
 
456 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  37.95 
 
 
441 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  39.26 
 
 
464 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  39.26 
 
 
464 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  40.33 
 
 
457 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  40.33 
 
 
457 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  38.83 
 
 
456 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  38.16 
 
 
460 aa  310  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  39.83 
 
 
465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  39.13 
 
 
471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  37.95 
 
 
460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  38.64 
 
 
465 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>