More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4055 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4055  replicative DNA helicase  100 
 
 		 504 aa  1025    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0766  replicative DNA helicase  64.99 
 
 		 503 aa  627  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0142  replicative DNA helicase  64.1 
 
 		 504 aa  589  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1928  replicative DNA helicase  53.09 
 
 		 496 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.671087  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0579  replicative DNA helicase  53.09 
 
 		 496 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1778  replicative DNA helicase  50.59 
 
 		 505 aa  488  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0594772  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0323  replicative DNA helicase  52.56 
 
 		 496 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  50.84 
 
 		 497 aa  475  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0987  replicative DNA helicase  49.9 
 
 		 496 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326082  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3494  replicative DNA helicase  50 
 
 		 498 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  51.63 
 
 		 493 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  50.41 
 
 		 506 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0450  replicative DNA helicase  49.27 
 
 		 501 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.741231  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  49.6 
 
 		 498 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0456  replicative DNA helicase  49.27 
 
 		 501 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  49.37 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  49.28 
 
 		 497 aa  463  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0563  replicative DNA helicase  48.65 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2594  replicative DNA helicase  48.77 
 
 		 495 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  50.1 
 
 		 498 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4633  replicative DNA helicase  49.48 
 
 		 495 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746602  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  45.78 
 
 		 500 aa  455  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4412  replicative DNA helicase  48.85 
 
 		 495 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3938  replicative DNA helicase  48.64 
 
 		 495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.19512 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1848  replicative DNA helicase  49.79 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2991  replicative DNA helicase  48.74 
 
 		 498 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4306  replicative DNA helicase  48.64 
 
 		 495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337711  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1515  replicative DNA helicase  46.94 
 
 		 498 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  48.43 
 
 		 496 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2458  replicative DNA helicase  48.74 
 
 		 498 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3808  replicative DNA helicase  47.46 
 
 		 502 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206642  normal  0.455208 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  49.69 
 
 		 499 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  48.02 
 
 		 496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1050  replicative DNA helicase  46.65 
 
 		 498 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1193  replicative DNA helicase  46.65 
 
 		 498 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0321974  normal  0.164958 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2873  replicative DNA helicase  50.61 
 
 		 494 aa  444  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5417  replicative DNA helicase  47.92 
 
 		 495 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  49.38 
 
 		 493 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1740  replicative DNA helicase  47.09 
 
 		 501 aa  435  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.057325  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0410  DnaB helicase  48.43 
 
 		 507 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1209  replicative DNA helicase  46.52 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0354  replicative DNA helicase  42 
 
 		 483 aa  371  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  40.67 
 
 		 494 aa  357  2.9999999999999997e-97  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0451  replicative DNA helicase  39.3 
 
 		 488 aa  343  4e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0571  replicative DNA helicase  39.09 
 
 		 488 aa  342  1e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  40.8 
 
 		 460 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  39.12 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  38.43 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  37.32 
 
 		 446 aa  316  6e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  37.81 
 
 		 466 aa  313  5.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  37.81 
 
 		 466 aa  313  5.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  40.42 
 
 		 512 aa  312  9e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  38.19 
 
 		 448 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  36.9 
 
 		 445 aa  309  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  39.42 
 
 		 476 aa  307  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  37.08 
 
 		 460 aa  306  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  37.32 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  37.08 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  39.23 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  37.11 
 
 		 453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  37.11 
 
 		 453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  37.11 
 
 		 453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  37.11 
 
 		 453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  37.11 
 
 		 453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  37.11 
 
 		 453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  37.11 
 
 		 453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  37.76 
 
 		 454 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  36.72 
 
 		 463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  38.8 
 
 		 472 aa  302  9e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  36.69 
 
 		 453 aa  302  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  39.54 
 
 		 476 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  41.46 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  36.69 
 
 		 449 aa  302  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  36.38 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  37.79 
 
 		 447 aa  300  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  37.06 
 
 		 454 aa  299  7e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  38.6 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  38.78 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  38.03 
 
 		 525 aa  298  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  37.65 
 
 		 465 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  38.46 
 
 		 471 aa  296  8e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  36.71 
 
 		 454 aa  296  8e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0041  replicative DNA helicase  38.07 
 
 		 514 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  39.33 
 
 		 444 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  38.1 
 
 		 481 aa  294  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27870  primary replicative DNA helicase  37.53 
 
 		 464 aa  294  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0308941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1360  replicative DNA helicase  35.18 
 
 		 473 aa  293  5e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  37.71 
 
 		 457 aa  293  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  37.71 
 
 		 457 aa  293  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  37.61 
 
 		 481 aa  292  8e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  37.45 
 
 		 443 aa  292  9e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  39.12 
 
 		 444 aa  292  9e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  36.93 
 
 		 470 aa  292  9e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  37.35 
 
 		 472 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  38 
 
 		 471 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  38 
 
 		 471 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  38.8 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  36.61 
 
 		 460 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  35.91 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  37.91 
 
 		 469 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>